24小时热门版块排行榜    

查看: 4129  |  回复: 23
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

arong9368

金虫 (正式写手)

[交流] 【求助】分子对接,却找不到对接位点,为何呢?已有2人参与

有没有人用DS的 CDOCKER模块分子对接呢?最近我在实验的一些黄酮类小分子与一种酶进行分子对接,却怎么也找不到对接位点,请问高人,这问题出在哪呢?
回复此楼

» 收录本帖的淘贴专辑推荐

分子对接问题锦集 蛋白模拟与改造

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

想自己所想,做自己该做!知道满足,学会放弃!不再拖延……
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

arong9368

金虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by zh1987hs at 2010-09-25 20:58:35:

楼主的问题不在软件上,而在于你对你的体系不是太了解:
1. 你的酶是否确定能和黄酮类物质结合~不能结合的话就不要谈活性位点了
2. 有没有相关文献报道类似的酶和黄酮类物质的结合?别人提及的活性位点为何? ...

谢谢你,回答的真细心。我查过了,没有找到相关的文章,但是老师让我分析0pose的原因,我刚接触,怎么整也没整明白,所以就上来求助了。我想问一下,你觉不觉的DS好像比较适合那种具有球形的结合空腔的蛋白质的分子对接呢?
想自己所想,做自己该做!知道满足,学会放弃!不再拖延……
7楼2010-09-25 22:54:45
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 24 个回答

arong9368

金虫 (正式写手)

没人回答呢,沉下去了?自己顶起来!
想自己所想,做自己该做!知道满足,学会放弃!不再拖延……
2楼2010-09-25 12:17:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ts2009

木虫 (著名写手)

无业游民

★ ★
arong9368(金币+1):谢谢参与
zh1987hs(金币+1):谢谢 2010-09-25 16:20:43
arong9368(金币+1):谢谢你,第一个帮我顶起帖子的 2010-09-26 11:36:04
你确定此种酶和黄酮类小分子能够作用的么?,可以的话肯定能找到活性口袋进行相互对接的。再试试吧
√:寂寞无边蔓延,触到无边伤感!
3楼2010-09-25 14:49:49
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

nh13

木虫 (正式写手)

★ ★
arong9368(金币+1):谢谢参与
zh1987hs(金币+1):谢谢~ 2010-09-25 19:50:47
用DS里面的Gold试试,精度高些。
4楼2010-09-25 16:31:26
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[硕博家园] 豫北虫友互识 +10 xuhongli903 2024-06-18 11/550 2024-06-20 00:25 by xuhongli903
[基金申请] 刚刚收到科研之友邮件 +8 olivermiaoer 2024-06-19 10/500 2024-06-20 00:06 by zhanghaozhu
[文学芳草园] 累并快乐着 +20 MYHLD521 2024-06-14 20/1000 2024-06-19 23:04 by tentoone
[找工作] 高校两个offer选择 +13 cowox2021 2024-06-18 14/700 2024-06-19 23:04 by feng6531
[考博] 关于读博感觉自己很抓马 +8 小九月 2024-06-19 11/550 2024-06-19 19:22 by 鱼翔浅底1
[基金申请] 面上基金有一个(两个)C是不是就没戏了.... 5+4 zzzm116 2024-06-13 21/1050 2024-06-19 18:35 by 匿名374
[基金申请] 面上博士后 +3 jsqy 2024-06-19 3/150 2024-06-19 17:58 by bxwisdom_886
[访问学者] 国家公派访问学者申请结果出了吗? +4 65syn 2024-06-13 4/200 2024-06-19 16:40 by 海洋之心168
[基金申请] Nature 11日发文,中国著名学者们称造假迫不得已 +8 babu2015 2024-06-14 8/400 2024-06-19 15:25 by 风今25
[基金申请] 博后基金刷到的BUG,图片来的更直观 +15 carolloo 2024-06-17 16/800 2024-06-19 09:42 by msjy
[精细化工] 试剂价格 +4 旭必上岸 2024-06-17 4/200 2024-06-18 23:58 by 又幂青松顶
[找工作] 杭电、天津科技、青农和宁波工程学院如何选? +12 味道很好啊 2024-06-13 24/1200 2024-06-18 23:09 by 药材
[考博] 2025考博 +8 自强不息a?a 2024-06-15 13/650 2024-06-18 18:12 by 投必得科研顾问
[论文投稿] 投稿求助 10+3 2022_灵魂工程师 2024-06-16 8/400 2024-06-18 12:12 by 投必得科研顾问
[有机交流] 求教最后一步问题出在哪 20+3 苏州浩恒 2024-06-15 4/200 2024-06-18 08:33 by like_2005
[论文投稿] 论文已接收,但发现修改稿传的是旧版该怎么办? +3 zsq54321 2024-06-15 6/300 2024-06-17 19:45 by wjykycg
[教师之家] 每次骚扰女学生的都是院系领导,而不是普通教师,小编们要注意措辞正确 +9 zju2000 2024-06-15 11/550 2024-06-16 14:49 by appleapple2
[论文投稿] 二审返修送审10天了,原来一审的3个审稿人只有2个接受了审稿,会邀请新审稿人么? 50+3 huanpo116 2024-06-15 5/250 2024-06-16 10:27 by bobvan
[论文投稿] 投了一篇4区的SCI,审稿人一个拒稿,一个小修,编辑给了大修。 +9 安稳22123 2024-06-13 10/500 2024-06-14 23:45 by jurkat.1640
[考博] 申博找导师 +4 疏影横斜水清浅3 2024-06-13 6/300 2024-06-14 14:31 by zxl_1105
信息提示
请填处理意见