24小时热门版块排行榜    

查看: 1787  |  回复: 21
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

piaoxue001

木虫 (正式写手)

[交流] 【求助】vasp优化团簇出错 求Pd的INCAR文件 已有2人参与

exit status of rank 1:killed by signal 11 。
请问这是怎么回事?

[ Last edited by piaoxue001 on 2010-9-18 at 11:17 ]
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

piaoxue001

木虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by 原子修补匠 at 2010-09-18 09:39:44:


对于这种情况,常常换一个节点就可以了。
其实正确的操作是先看看要计算的节点的cpu使用的情况,有时候即使没有程序在运行但是cpu却没有完全的释放。这个时候如果你提交了作业,常常会出现你说的情况。重启这 ...

非常感谢     我降低一下精度试试   请问怎么重启节点?  我看了     计算完之后CPU几乎被完全释放
9楼2010-09-18 09:45:12
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 22 个回答

piaoxue001

木虫 (正式写手)

有哪位遇到过这种情况?希望探讨一下
2楼2010-09-17 21:00:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

calos818

木虫 (著名写手)

新人菜鸟

★ ★
zzy870720z(金币+1):谢谢回复 2010-09-19 07:58:20
zxzj05(金币+1):奖励 2010-09-20 17:19:08
引用回帖:
Originally posted by piaoxue001 at 2010-09-16 20:52:53:
exit status of rank 1:killed by signal 11 。
请问这是怎么回事?

[ Last edited by piaoxue001 on 2010-9-17 at 16:28 ]

贴出INCAR 和KPOINTS ,负载过大造成的
3楼2010-09-17 21:30:55
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

piaoxue001

木虫 (正式写手)

优化大团簇时,我也认为是超负载了  后来试了一下Pd5的还是这个问题。
以下是INCAR KPOINTS  POSCAR文件
SYSTEM=Pd38
ENCUT=270
ISTART=0
ICHARG=2
NSW=100
IBRION=2
PREC=Accurate

Automatic mesh
0
G
1  1  1
0  0  0

system=Pd38
1
       30.000000000000000       0.000000000000000       0.000000000000000
       0.000000000000000       30.000000000000000       0.000000000000000
       0.000000000000000        0.000000000000000       30.000000000000000
38
direct
  0.4629252752788721   0.5616948352295882   0.6707640444643583
  0.5465478230122054   0.4338832067629213   0.4702994818976922
  0.5744990819455389   0.5270870873629213   0.6032497969976918
  0.4333739811455388   0.6570604710962547   0.4401341109976922
  0.5695184941122056   0.5634122973629214   0.4427157540643589
  0.3875017984455368   0.3981881124629214   0.4955416194976921
  0.3234987950455368   0.5028416448295880   0.6057023985643583
  0.5055142131788722   0.6680635790962546   0.5528767217643588
  0.3464696868455368   0.6323701602629214   0.5781183763310255
  0.4596422018788721   0.4091916519629213   0.6082844518976917
  0.3185168440788701   0.5391670510962549   0.4451679270643589
  0.3860815941122035   0.5866617314629214   0.3974834738643589
  0.3711649247455368   0.5732640625629214   0.6486546802310249
  0.3626766025122035   0.4570132671962546   0.4252400405310255
  0.4300908432122055   0.5045592110962547   0.3776530817310255
  0.4792755621788722   0.3865528478962547   0.5177661992976922
  0.2989744700122035   0.5618478034962547   0.5352518273976922
  0.5254212019788722   0.6452839937629213   0.4625508496310256
  0.4137408404788722   0.6796988835629215   0.5306521936310256
  0.5940428412122055   0.5044061944629213   0.5131662928976922
  0.3675948343455368   0.4209682859962546   0.5858675995643589
  0.5303392110122055   0.6092403495295881   0.6231772772310249
  0.5069342795122056   0.4795922053962546   0.6509339520976917
  0.5218527893788723   0.4929897573962547   0.3997628979643588
  0.3303522946455368   0.4733050464629213   0.5143288412976922
  0.4556354204122055   0.4347023867629213   0.4382560826310256
  0.5367401792122054   0.4473725137295880   0.5652252058310255
  0.5626643156122054   0.5929483212629214   0.5340892992976922
  0.3562760611455368   0.6188810467295881   0.4831926858310255
  0.4114083680122035   0.4860719879629213   0.6412749697643584
  0.4816085300788721   0.5801813999962547   0.4071423618643589
  0.4373812376455389   0.6315508087295879   0.6101617868310250
  0.5016337307122055   0.5158925480295881   0.4905155699643589
  0.4105967472788701   0.5274605464629214   0.4684367361976922
  0.4578590743122055   0.5971351891629214   0.5103500595976922
  0.3913821804455368   0.5503602563295881   0.5579024386310255
  0.4824206038455388   0.5387922195295881   0.5799823551310255
  0.4351576879788722   0.4691198259295880   0.5380669846976922
4楼2010-09-18 08:18:33
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通表情 高级回复 (可上传附件)
信息提示
请填处理意见