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夏天的鱼木虫 (小有名气)
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[交流]
【求助】amber功能探讨
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| 请问一下，amber是不是不可以做蛋白嵌入磷脂双层膜的体系啊？非常非常感谢大家可以参与讨论！ |
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bay__gulf
金虫 (著名写手)
刘苏州
- 模拟EPI: 8
- 应助: 9 (幼儿园)
- 贵宾: 4.85
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- 红花: 1
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- 虫号: 592012
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- 专业: 理论和计算化学
- 管辖: 分子模拟
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夏天的鱼(金币+3): 2010-09-21 16:07:11
夏天的鱼(金币+3): 2010-09-21 16:07:26
zh1987hs(金币+5):专家出现了~呵呵 2010-09-21 16:17:32
夏天的鱼(金币+3): 2010-09-21 16:07:11
夏天的鱼(金币+3): 2010-09-21 16:07:26
zh1987hs(金币+5):专家出现了~呵呵 2010-09-21 16:17:32
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只要有合适的力场, 比如amber, charmm 等 几乎是任何一款MD 软件都可以做的 amber 的确可以, 其他的软件也各有优劣 否则就不会有这么多MD 软件了 如果楼主所在的课题组有amber 使用经验的话, 用amber 是可以的 要是从头学的话, amber 并不是首选 主要是因为它的速度较慢, 而膜蛋白又是极耗费计算资源的课题 |
9楼2010-09-21 15:23:30