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yylww至尊木虫 (知名作家)
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[交流]
【求助】NAMD进行恒温压缩的过程中，原子速度过大，怎么解决？
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请问，在进行恒温压缩的过程中，由于原子速度过大而无法进行压缩的情况，怎么解决这个问题呢？ 通过减少原子的数目这些都不行。 ERROR: Atom 32833 velocity is 1.53393e+006 9.6171e+006 -1.24048e+006 (limit is 12000) ERROR: Atom 32869 velocity is -862137 -160590 -1.08782e+006 (limit is 12000) ERROR: Atom 32887 velocity is 3697.81 13841.1 7305.32 (limit is 12000) ERROR: Atom 32888 velocity is -7854.45 15767.2 -2453.33 (limit is 12000) ERROR: Atoms moving too fast; simulation has become unstable. ERROR: Atom 30757 velocity is 5.07685e+007 479918 -1.66144e+007 (limit is 12000) ERROR: Atom 31470 velocity is 1.51503e+007 411299 -7.33521e+006 (limit is 12000) ERROR: Atom 31579 velocity is -3254.53 -14790.6 -7047.76 (limit is 12000) ERROR: Atoms moving too fast; simulation has become unstable. |
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manutdhk
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3楼2010-09-05 19:11:12