| 查看: 763 | 回复: 2 | |||
z5476t4508新虫 (正式写手)
明天家
|
[交流]
【求助】关于ONIOM输入文件 已有1人参与
|
|
初学ONIOM，摆脱大家指点一下！ 我在高斯手册里发现一个例子： # ONIOM(B3LYP/6-31G(d):Amber) Geom=Connectivity 2 layer ONIOM job 0 1 0 1 0 1 Charge/spin for entire molecule (real system), model system-high level & model-low C-CA--0.25 0 -4.703834 -1.841116 -0.779093 L C-CA--0.25 0 -3.331033 -1.841116 -0.779093 L H-HA-0.1 3 C-CA--0.25 0 -2.609095 -0.615995 -0.779093 H C-CA--0.25 0 -3.326965 0.607871 -0.778723 H C-CA--0.25 0 -4.748381 0.578498 -0.778569 H C-CA--0.25 0 -5.419886 -0.619477 -0.778859 L H-HC-0.1 5 H-HA-0.1 0 -0.640022 -1.540960 -0.779336 L H-HA-0.1 0 -5.264565 -2.787462 -0.779173 L H-HA-0.1 0 -2.766244 -2.785438 -0.779321 L C-CA--0.25 0 -1.187368 -0.586452 -0.779356 L H-HA-0.1 3 C-CA--0.25 0 -2.604215 1.832597 -0.778608 H H-HA-0.1 0 -5.295622 1.532954 -0.778487 L H-HA-0.1 5 H-HA-0.1 0 -6.519523 -0.645844 -0.778757 L C-CA--0.25 0 -1.231354 1.832665 -0.778881 L H-HC-0.1 11 C-CA--0.25 0 -0.515342 0.610773 -0.779340 L H-HA-0.1 0 -3.168671 2.777138 -0.778348 L H-HA-0.1 11 H-HA-0.1 0 -0.670662 2.778996 -0.779059 L H-HA-0.1 0 0.584286 0.637238 -0.779522 L 1 2 1.5 6 1.5 8 1.0 2 3 1.5 9 1.0 3 4 1.5 10 1.5 4 5 1.5 11 1.5 5 6 1.5 12 1.0 6 13 1.0 7 10 1.0 8 9 10 15 1.5 11 14 1.5 16 1.0 12 13 14 15 1.5 17 1.0 15 18 1.0 16 17 18 如果 01 01 01 分别指的是整个体系的电荷、自旋；量子区域的电荷和自旋的话，那么也就是说整个体系和量子区域的总电量都是0啦，可是吧输入文件里的原子电荷加起来并不是0呀，C的是-0.25, H的是0.1.... |
回复此楼» 猜你喜欢
求助：三乙酰丙酮铁（Fe(acac)₃）标准红外(IR)与XRD谱图/数据
已经有1人回复
-
分子动力学 Plumed教程求助
已经有0人回复
-
物理化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有137人回复
-
研究生学术新锐奖｜宁波微纳材料研讨会参会通知
已经有2人回复
-
申请2027年材料/化学类博士
已经有6人回复
-
求相关合成条件
已经有12人回复
-
2027春季申博自荐
已经有6人回复
-
青基的材料青椒们，可以把硕士联培生送我这里，要研二男生
已经有63人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 第一原理动力学的系综选择，和各种系综的输入文件Example
已经有13人回复
- DFT Scan之后使用MP2计算能量，如何建立批量输入文件？
已经有6人回复
- 我的输入文件 一开始就出现错误 怎么办呢、。。。。。
已经有6人回复
- 求助：dushin程序输入文件无法读取！！！1
已经有10人回复
- 三维数组换行输入到文件（intel fortran 编译器）
已经有6人回复
- gaussian09输入文件
已经有8人回复
- 结构优化中问题
已经有6人回复
- 【整理】今天整理硬盘上的资料，偶然发现的好玩的小东西就直接发上来吧
已经有106人回复
- 【求助】生成赝式时出现“jjs wrong” 输入文件如下
已经有7人回复
- 【求助】siesta输入文件中赝势文件的作用？
已经有8人回复
- 【求助】GV输出的Oniom输入文件如何修改
已经有17人回复
xianweiwang
铁虫 (小有名气)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 22.1
- 散金: 610
- 红花: 1
- 帖子: 60
- 在线: 45.9小时
- 虫号: 963122
- 注册: 2010-03-06
- 专业: 理论和计算化学
z5476t4508(金币+10):xiexie 2010-09-06 13:41:04
|
加上下面的几行试试 HrmStr1 N CA 490.0 1.335 HrmStr1 C H2 490.0 1.335 HrmStr1 CA CA 490.0 1.335 HrmBnd1 CA N CA 70.0 116.000 HrmBnd1 CA N C 70.0 116.000 HrmBnd1 CA CA N 70.0 116.000 HrmBnd1 CA N H2 70.0 116.000 HrmBnd1 N CA H4 70.0 116.000 HrmBnd1 N C H2 70.0 116.000 HrmBnd1 O C H2 70.0 116.000 |
2楼2010-08-31 17:09:59
3楼2010-09-13 14:01:58
投票:
30