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asd1zxc

金虫 (正式写手)

[交流] 【求助】高人指点DS2.5CDOCKER 已有3人参与

我在做CDOCKER分子对接,总感觉结果中的10个poses奇奇怪怪的,肯定不是优势构想,请问在做对接之前,小分子除了加氢之外还要经过其他手段处理啊?  请解释一下,小弟菜鸟。
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asd1zxc

金虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by 克罗米虎 at 2010-08-18 16:01:28:
还可以Energy Minimize一下~

请问用哪个protocol进行Energy Minimize啊,谢谢了,是不是prepare ligands啊?
5楼2010-08-19 15:30:30
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克罗米虎

金虫 (小有名气)


ghcacj(金币+1):谢谢 2010-08-18 18:20:24
asd1zxc(金币+1):谢谢了,能详细点吗 2010-08-18 19:52:39
还可以Energy Minimize一下~
专业的计算模拟服务:http://www.wecomput.com
2楼2010-08-18 16:01:28
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asd1zxc

金虫 (正式写手)

大家帮帮忙啦,小弟菜鸟,指导一下
4楼2010-08-19 15:29:12
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tjegg

铁杆木虫 (著名写手)

★ ★
asd1zxc(金币+2): 2010-08-19 15:47:13
ghcacj(金币+2):谢谢 2010-08-19 16:28:21
引用回帖:
Originally posted by asd1zxc at 2010-08-18 15:43:46:
我在做CDOCKER分子对接,总感觉结果中的10个poses奇奇怪怪的,肯定不是优势构想,请问在做对接之前,小分子除了加氢之外还要经过其他手段处理啊?  请解释一下,小弟菜鸟。

要做的工作:加氢,加力场,附电荷,简单500-1000部的优化。
除了你的亲人,没有人应该对你好,对你好的人,一定要珍惜。
6楼2010-08-19 15:42:36
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