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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 【求助/交流】关于酶切位点保护碱基
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ymzfeng

金虫 (小有名气)

[交流] 【求助/交流】关于酶切位点保护碱基 已有2人参与

想请问下限制性酶切位点的保护碱基会影响连接效率吗？
保护碱基设置不好，对连接和酶切是不是都会有影响？
比如：BamH1的保护碱基是：CGGGATCCCG，若设计引物时误写成了CGGGATCCC这样对后面的实验会有怎样的影响了？
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1楼 2010-08-04 11:07:56
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fungixx

至尊木虫 (文坛精英)

优秀版主优秀版主优秀版主
绝对不会有影响的，只要是别少于酶需要的数量就行，你的CGGGATCCC后面应该还有碱基吧！
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几年前踏上火车那一刻都还没有意识到,从此故乡只有冬夏,再无春秋
2楼2010-08-05 13:53:01
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ymzfeng

金虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by fungixx at 2010-08-05 13:53:01:
绝对不会有影响的，只要是别少于酶需要的数量就行，你的CGGGATCCC后面应该还有碱基吧！

别少于酶需要的数量是什么意思？谢谢
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3楼2010-08-05 16:00:14
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fungixx

至尊木虫 (文坛精英)

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引用回帖:
Originally posted by ymzfeng at 2010-08-05 16:00:14:

别少于酶需要的数量是什么意思？谢谢


拿BamhI说吧，它的保护碱基只要一个时酶切效率就能达到50-100%，所以只要你的酶切位点左右的碱基数目超过1个酶切效率就能很高了。。。。
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几年前踏上火车那一刻都还没有意识到,从此故乡只有冬夏,再无春秋
4楼2010-08-05 16:08:48
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