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ymzfeng

金虫 (小有名气)

[交流] 【求助/交流】关于酶切位点保护碱基 已有2人参与

想请问下限制性酶切位点的保护碱基会影响连接效率吗?
保护碱基设置不好,对连接和酶切是不是都会有影响?
比如:BamH1的保护碱基是:CGGGATCCCG,若设计引物时误写成了CGGGATCCC这样对后面的实验会有怎样的影响了?
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fungixx

至尊木虫 (文坛精英)

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绝对不会有影响的,只要是别少于酶需要的数量就行,你的CGGGATCCC后面应该还有碱基吧!
几年前踏上火车那一刻都还没有意识到,从此故乡只有冬夏,再无春秋
2楼2010-08-05 13:53:01
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ymzfeng

金虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by fungixx at 2010-08-05 13:53:01:
绝对不会有影响的,只要是别少于酶需要的数量就行,你的CGGGATCCC后面应该还有碱基吧!

别少于酶需要的数量是什么意思?谢谢
3楼2010-08-05 16:00:14
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fungixx

至尊木虫 (文坛精英)

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小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by ymzfeng at 2010-08-05 16:00:14:

别少于酶需要的数量是什么意思?谢谢


拿BamhI说吧,它的保护碱基只要一个时酶切效率就能达到50-100%,所以只要你的酶切位点左右的碱基数目超过1个酶切效率就能很高了。。。。
几年前踏上火车那一刻都还没有意识到,从此故乡只有冬夏,再无春秋
4楼2010-08-05 16:08:48
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