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hnndpt

铁虫 (正式写手)

[交流] 【求助/交流】如何查找mRNA序列的阅读框？求助！已有7人参与

我在NCBI中检索到目的基因的mRNA序列，如何能查找到他的阅读框？是不是有软件可以用？或者说是某软件的某个功能？希望大家可以指点一下，越详细越好，新手上路，不是很懂啊！
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1楼2010-08-04 09:26:20
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ymzfeng

金虫 (小有名气)
hnndpt(金币+1): 2010-08-04 17:06:27
NCBI上就有工具：ORFfinder 可以用于寻找ORF
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6楼2010-08-04 12:37:06
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susizheng

木虫 (著名写手)

我們是糖 甜到憂傷
★
看天(金币+1):鼓励回答 2010-08-04 11:12:55
hnndpt(金币+1): 2010-08-04 17:06:07
序列之上有注释，在注释里面找到CDS，点击进入就可以了。
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Thank-you，so-blue.
2楼2010-08-04 10:21:04
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周_yan

木虫 (小有名气)
★ ★
看天(金币+2):鼓励回答 2010-08-04 11:13:32
hnndpt(金币+1): 2010-08-04 17:06:13
利用软件将其翻译成蛋白序列，这时会有三个阅读框，然后在这阅读框中找到第一个出现M的阅读框，并且这个阅读框中终止密码子比较少，这个阅读框就是就是你所要的。
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3楼2010-08-04 10:31:37
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看天

木虫 (知名作家)
好行不确定的时候先翻译出来 然后对比
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戒嗔怒以养肝气，省言语以养神气，多读书以养质气，顺时令以养元气，不拘节以养大气，观天变以养灵气，莫强求规于运气。
4楼2010-08-04 11:14:03
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