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南方科技大学公共卫生及应急管理学院2025级博士研究生招生报考通知
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hnndpt

铁虫 (正式写手)

[交流] 【求助/交流】如何查找mRNA序列的阅读框?求助!已有7人参与

我在NCBI中检索到目的基因的mRNA序列,如何能查找到他的阅读框?是不是有软件可以用?或者说是某软件的某个功能?希望大家可以指点一下,越详细越好,新手上路,不是很懂啊!
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susizheng

木虫 (著名写手)

我們是糖 甜到憂傷


看天(金币+1):鼓励回答 2010-08-04 11:12:55
hnndpt(金币+1): 2010-08-04 17:06:07
序列之上有注释,在注释里面找到CDS,点击进入就可以了。
Thank-you,so-blue.
2楼2010-08-04 10:21:04
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周_yan

木虫 (小有名气)

★ ★
看天(金币+2):鼓励回答 2010-08-04 11:13:32
hnndpt(金币+1): 2010-08-04 17:06:13
利用软件将其翻译成蛋白序列,这时会有三个阅读框,然后在这阅读框中找到第一个出现M的阅读框,并且这个阅读框中终止密码子比较少,这个阅读框就是就是你所要的。
3楼2010-08-04 10:31:37
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看天

木虫 (知名作家)

好行不确定的时候先翻译出来 然后对比
戒嗔怒以养肝气,省言语以养神气,多读书以养质气,顺时令以养元气,不拘节以养大气,观天变以养灵气,莫强求规于运气。
4楼2010-08-04 11:14:03
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xingzhb

木虫 (著名写手)

利用软件分析啊
为生活所迫而科研
5楼2010-08-04 11:21:58
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ymzfeng

金虫 (小有名气)

hnndpt(金币+1): 2010-08-04 17:06:27
NCBI上就有工具:ORFfinder 可以用于寻找ORF
6楼2010-08-04 12:37:06
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silicare

荣誉版主 (文坛精英)

合伙创业版兼职版主

优秀版主

atg和rbs
7楼2010-08-04 13:35:23
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webmasterone752

金虫 (正式写手)

既然是NCBI,那就有cds的注释咯 仔细找下啊
8楼2010-08-07 22:47:12
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