24小时热门版块排行榜    

查看: 2149  |  回复: 5
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

chemzhh

至尊木虫 (著名写手)

[交流] 【求助】问如何选择基组精确计算有机小分子结构和能量的问题 已有2人参与

我在计算一个有机小分子C8H8ClNO,用6-31+G*计算,发现两个不同构型的能量相差0.45kcal/mol,现在想用更大的基组计算一下,以获取更准确的结构和能量信息,请教大家用什么基组比较好。另外在Gaussian的输入文件中有什么要注意的,还是直接opt freq=noraman等等就行了,谢谢!
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jiewei

专家顾问 (著名写手)

小才

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
heyo_123(金币+1):鼓励交流!! 2010-07-30 20:41:24
你算吉布斯自由能干嘛呢?   
这样吧, 你试试用不同的稳定优化一个分子,看是不是结构会改变?  

根据我做的这么多芳香分子来看,基本上是不改变的(可能有很细微的改变,在正常的范围内,不会像楼主说的那样有构型上的变化 ) 所以个人觉得高斯计算的结果都是理想情况下 你输入构型附近优化构型. 比较哪个构型比较稳定,只需要比较最后几种构型的单分子能量就是了. 这个在你输出文件的后面可以找到
我想做个科学家,可我又喜欢写诗;我想做一个诗人,可我却读的理工科..
6楼2010-07-30 18:40:48
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 6 个回答

jiewei

专家顾问 (著名写手)

小才

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
heyo_123(金币+1):鼓励交流!! 2010-07-30 20:40:56
你的分子是自由基? 离子? 中性芳香分子?  用的方法是?  等等你都没有交代清楚...谁知道应该用什么基组和方法.....
还有你这个体系是否含有氢键? 等等 ...
把上述问题回答了 .我来给你简单吧
我想做个科学家,可我又喜欢写诗;我想做一个诗人,可我却读的理工科..
2楼2010-07-30 11:55:39
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

chemzhh

至尊木虫 (著名写手)

谢谢。这是一个中性芳环分子,体系没有氢键,我用B3LYP来优化,期待楼上的回复。
3楼2010-07-30 12:09:51
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jiewei

专家顾问 (著名写手)

小才

★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
heyo_123(金币+2):鼓励交流!!! 2010-07-30 20:41:09
记得回复帖子的时候, 引用我的贴, 不然我这里没有提示的.

我感觉你的那个+  是可以省略的  尝试基组 6-31G(2d,3p)  在输入文件的时候需要注意的就是 去掉对称性进行计算

另外:  你的两个构型能量不是相差很小(你是这么认为的吧?) 而达到了0.02eV每单分子.这已经是可以区分那个构型更加稳定
我想做个科学家,可我又喜欢写诗;我想做一个诗人,可我却读的理工科..
4楼2010-07-30 12:39:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[找工作] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +3 cqwQDCxMcL3I 2026-09-29 4/200 2026-09-30 16:33 by Z9YWQ5EAO3qp
[考研] 售SCI一区文章,我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +3 cqwQDCxMcL3I 2026-09-29 6/300 2026-09-30 16:14 by Z9YWQ5EAO3qp
[教师之家] 某top大学教授说“能够在市场中兑现的能力才是真能力”无比同意! +10 zju2000 2026-09-26 13/650 2026-09-30 10:26 by yexuqing
[博后之家] 售SCI文章,我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +4 IDs3scOF0tjC 2026-09-28 4/200 2026-09-29 19:27 by cqwQDCxMcL3I
[找工作] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +4 ZYXdhzDAy9ZX 2026-09-28 4/200 2026-09-29 16:54 by yCO1Ll7aHtsw
[考博] 售一区SCI文章T0P,我:8O.551.O54,科目全,可十急 +3 tqUTOxClQUMF 2026-09-28 3/150 2026-09-29 15:46 by etmYJ6d2rquH
[博后之家] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 tqUTOxClQUMF 2026-09-28 3/150 2026-09-29 15:04 by etmYJ6d2rquH
[公派出国] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +3 tqUTOxClQUMF 2026-09-28 3/150 2026-09-29 14:58 by etmYJ6d2rquH
[考博] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +6 GDBe8tDZqE8z 2026-09-28 6/300 2026-09-29 14:41 by etmYJ6d2rquH
[找工作] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +6 IDs3scOF0tjC 2026-09-28 6/300 2026-09-29 14:13 by etmYJ6d2rquH
[博后之家] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +6 IDs3scOF0tjC 2026-09-28 7/350 2026-09-29 14:07 by etmYJ6d2rquH
[考研] 售一区SCI文章T0P,我:8O.551.O54,科目全,可十急 +3 tqUTOxClQUMF 2026-09-28 3/150 2026-09-29 09:59 by JzYBbHIXWSrW
[教师之家] 售一区SCI文章T0P,我:8O.551.O54,科目全,可十急 +4 GDBe8tDZqE8z 2026-09-28 4/200 2026-09-29 09:49 by JzYBbHIXWSrW
[考研] 售SCI一区文章,我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +3 ZYXdhzDAy9ZX 2026-09-28 3/150 2026-09-29 06:42 by ZvyPK8n6Nfki
[找工作] 售SCI一区文章,我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +3 ZYXdhzDAy9ZX 2026-09-28 3/150 2026-09-29 06:28 by ZvyPK8n6Nfki
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 tqUTOxClQUMF 2026-09-28 3/150 2026-09-28 23:46 by b8fCuTHqckEt
[考研] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 GDBe8tDZqE8z 2026-09-28 3/150 2026-09-28 23:12 by b8fCuTHqckEt
[公派出国] 售SCI一区文章,我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +4 IDs3scOF0tjC 2026-09-28 4/200 2026-09-28 22:55 by ez6fGg9abYaj
[找工作] 售SCI文章,我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +3 IDs3scOF0tjC 2026-09-28 5/250 2026-09-28 22:32 by ez6fGg9abYaj
[考研] 售一区SCI文章T0P,我:8O.551.O54,科目全,可十急 +3 IDs3scOF0tjC 2026-09-28 4/200 2026-09-28 18:51 by 9lS3ad5oOymn
信息提示
请填处理意见