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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 【求助】问如何选择基组精确计算有机小分子结构和能量的问题
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chemzhh

至尊木虫 (著名写手)

[交流] 【求助】问如何选择基组精确计算有机小分子结构和能量的问题 已有2人参与

我在计算一个有机小分子C8H8ClNO，用6-31+G*计算，发现两个不同构型的能量相差0.45kcal/mol，现在想用更大的基组计算一下，以获取更准确的结构和能量信息，请教大家用什么基组比较好。另外在Gaussian的输入文件中有什么要注意的，还是直接opt freq=noraman等等就行了，谢谢！
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1楼 2010-07-30 09:59:42
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jiewei

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小才
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heyo_123(金币+1):鼓励交流！！ 2010-07-30 20:40:56
你的分子是自由基? 离子? 中性芳香分子?  用的方法是?  等等你都没有交代清楚...谁知道应该用什么基组和方法.....
还有你这个体系是否含有氢键? 等等 ...
把上述问题回答了 .我来给你简单吧
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我想做个科学家，可我又喜欢写诗；我想做一个诗人，可我却读的理工科..
2楼2010-07-30 11:55:39
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chemzhh

至尊木虫 (著名写手)
谢谢。这是一个中性芳环分子，体系没有氢键，我用B3LYP来优化，期待楼上的回复。
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3楼2010-07-30 12:09:51
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jiewei

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小才
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heyo_123(金币+2):鼓励交流！！！ 2010-07-30 20:41:09
记得回复帖子的时候, 引用我的贴, 不然我这里没有提示的.

我感觉你的那个+  是可以省略的  尝试基组 6-31G(2d,3p)  在输入文件的时候需要注意的就是 去掉对称性进行计算

另外:  你的两个构型能量不是相差很小(你是这么认为的吧?) 而达到了0.02eV每单分子.这已经是可以区分那个构型更加稳定
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我想做个科学家，可我又喜欢写诗；我想做一个诗人，可我却读的理工科..
4楼2010-07-30 12:39:37
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chemzhh

至尊木虫 (著名写手)

谢谢楼上的回复

谢谢楼上的回复。根据deltaG=-RTlnK计算，这两者的比例大约是0.5：1(不知道这样处理对不对)，是不是根据这个计算的结果(如果能够这样处理)说明能量相差不是很小。谢谢赐教。
引用回帖:
Originally posted by jiewei at 2010-07-30 12:39:37:
记得回复帖子的时候, 引用我的贴, 不然我这里没有提示的.

我感觉你的那个+  是可以省略的  尝试基组 6-31G(2d,3p)  在输入文件的时候需要注意的就是 去掉对称性进行计算

另外:  你的两个构型能量不是相差很 ...

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5楼2010-07-30 15:45:40
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jiewei

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小才
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heyo_123(金币+1):鼓励交流！！ 2010-07-30 20:41:24
你算吉布斯自由能干嘛呢?   
这样吧, 你试试用不同的稳定优化一个分子,看是不是结构会改变?  

根据我做的这么多芳香分子来看,基本上是不改变的(可能有很细微的改变,在正常的范围内,不会像楼主说的那样有构型上的变化 ) 所以个人觉得高斯计算的结果都是理想情况下 你输入构型附近优化构型. 比较哪个构型比较稳定,只需要比较最后几种构型的单分子能量就是了. 这个在你输出文件的后面可以找到
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我想做个科学家，可我又喜欢写诗；我想做一个诗人，可我却读的理工科..
6楼2010-07-30 18:40:48
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