24小时热门版块排行榜    

查看: 1760  |  回复: 10
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

xmc8362

银虫 (正式写手)

[交流] 【求助】Si(100)表面吸附成键问题 已有6人参与

计算Si(100)表面C的吸附,发现在顶位吸附时,一般计算后C与Si未显示成键;

而如果计算 CN 在 Si(100)表面顶位垂直吸附时(C在下),则显示N与Si成键(点击后呈黄色),而中间的C反而不成键。这样的结果合理吗?


[ Last edited by xmc8362 on 2010-7-19 at 21:50 ]
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xmc8362

银虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by 渔火江枫 at 2010-07-20 18:55:15:
我觉得MS中显示成键与否,应该是软件中有个阈值,小于它显示bond,大于它则不显示,似乎跟化学意义上成键没有必然联系。如果判断是否成键,还要看原子间的距离跟文献中或实验值是否相近。

谢谢!
我也是这么认为的。
可是上面两个C吸附的图示中结构参数几乎一样,但从模型建立开始就是一个图中C与Si未显示成键,而另外一个图中C与Si显示成键,优化后还是如此。好像不是简单的阈值问题。
MS中的“阈值”在哪里设置?

[ Last edited by xmc8362 on 2010-7-20 at 23:02 ]
4楼2010-07-20 22:59:45
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 11 个回答

xmc8362

银虫 (正式写手)

特别难理解的是,有的时候建模优化又显示成键!!


[ Last edited by xmc8362 on 2010-7-20 at 23:01 ]
2楼2010-07-20 18:04:33
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

渔火江枫

金虫 (小有名气)

★ ★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
zzy870720z(金币+2):谢谢指点,MS确实存在这种情况,还是应该看成键信息,不应该根据图来判断 2010-07-20 19:15:31
hometownlove(金币+2):说得很有道理 2010-07-21 10:06:46
我觉得MS中显示成键与否,应该是软件中有个阈值,小于它显示bond,大于它则不显示,似乎跟化学意义上成键没有必然联系。如果判断是否成键,还要看原子间的距离跟文献中或实验值是否相近。
IdeasWorthSpreading!
3楼2010-07-20 18:55:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

渔火江枫

金虫 (小有名气)

★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
zzy870720z(金币+2):谢谢指导 2010-07-22 20:00:59
引用回帖:
Originally posted by xmc8362 at 2010-07-20 22:59:45:

谢谢!
我也是这么认为的。
可是上面两个C吸附的图示中结构参数几乎一样,但从模型建立开始就是一个图中C与Si未显示成键,而另外一个图中C与Si显示成键,优化后还是如此。好像不是简单的阈值问题。
MS中的“ ...

在MS中有个Bond Cacluation工具,可以在build下拉菜单中找到,它可以调整成键的阈值
IdeasWorthSpreading!
5楼2010-07-22 16:34:50
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 今日不放榜?网传国自然预计 8 月 27 日可查结果 +15 医学老男孩 2026-08-20 18/900 2026-08-21 13:46 by 医学老男孩
[基金申请] 感觉是下周放榜了 +7 angus9576 2026-08-17 12/600 2026-08-21 13:38 by weiyin
[基金申请] 我面上完蛋了 +7 且听虎啸 2026-08-20 8/400 2026-08-21 12:31 by 酷酷墨镜
[基金申请] 只有每年这种时候来逛逛小木虫 +23 yaoyewhu2008 2026-08-20 25/1250 2026-08-21 12:19 by Poppy1104
[基金申请] 时间戳又变了 +12 wuchongjun 2026-08-20 18/900 2026-08-21 11:53 by wuchongjun
[基金申请] 今天基金会出结果吗?20260819 +15 kkkl_v 2026-08-19 16/800 2026-08-21 11:22 by 365372687
[论文投稿] 投稿咨询 +5 wwm09 2026-08-17 7/350 2026-08-21 10:11 by 期刊论文帮手
[基金申请] 今天放榜没戏了吧 +9 yuleib84 2026-08-19 11/550 2026-08-21 10:06 by gltch
[基金申请] 基金啊基金 +4 longfie172 2026-08-20 4/200 2026-08-21 08:58 by mark mao
[基金申请] 估计是周四 +3 archvillain 2026-08-18 3/150 2026-08-21 01:48 by jnhyjjm
[基金申请] 今天系统多次维护,明天很可能放榜! +10 zju2000 2026-08-16 11/550 2026-08-20 20:02 by cl479861084
[基金申请] 时间戳变了,能看出什么问题? +18 基诺咪客 2026-08-17 23/1150 2026-08-20 17:19 by Godzela
[教师之家] 为什么余额宝的年化利率越来越低?主要原因有哪些? +5 瞬息宇宙 2026-08-15 5/250 2026-08-19 20:23 by super2002521
[基金申请] 今天放榜吗? +14 布布和一二 2026-08-19 15/750 2026-08-19 18:07 by gltch
[基金申请] 2027广东省杰青 +4 奶牛小黑 2026-08-15 10/500 2026-08-19 11:02 by wanfengnew
[基金申请] 朋友圈看到的 +6 wangzilk 2026-08-18 8/400 2026-08-19 10:55 by Haru815
[基金申请] 快农历七夕节了,轻松一下,男人悄悄话,女施主请不要进来。 +6 Tide man 2026-08-14 7/350 2026-08-19 09:56 by ZJTJZ
[基金申请] 明天放榜? +5 Shxjjxjkx 2026-08-18 5/250 2026-08-18 18:14 by -大大大大大-
[基金申请] 今天维护系统维护 祝所有人 高中 +8 gjjjzhong 2026-08-18 9/450 2026-08-18 13:01 by 家与远方
[基金申请] 93BebMhtakh前后11位开头都是大写 +4 且听虎啸 2026-08-17 5/250 2026-08-18 00:49 by 蔡棒棒菂
信息提示
请填处理意见