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xmc8362

银虫 (正式写手)

[交流] 【求助】Si(100)表面吸附成键问题 已有6人参与

计算Si(100)表面C的吸附,发现在顶位吸附时,一般计算后C与Si未显示成键;

而如果计算 CN 在 Si(100)表面顶位垂直吸附时(C在下),则显示N与Si成键(点击后呈黄色),而中间的C反而不成键。这样的结果合理吗?


[ Last edited by xmc8362 on 2010-7-19 at 21:50 ]
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渔火江枫

金虫 (小有名气)

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zzy870720z(金币+2):谢谢指点,MS确实存在这种情况,还是应该看成键信息,不应该根据图来判断 2010-07-20 19:15:31
hometownlove(金币+2):说得很有道理 2010-07-21 10:06:46
我觉得MS中显示成键与否,应该是软件中有个阈值,小于它显示bond,大于它则不显示,似乎跟化学意义上成键没有必然联系。如果判断是否成键,还要看原子间的距离跟文献中或实验值是否相近。
IdeasWorthSpreading!
3楼2010-07-20 18:55:15
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xmc8362

银虫 (正式写手)

特别难理解的是,有的时候建模优化又显示成键!!


[ Last edited by xmc8362 on 2010-7-20 at 23:01 ]
2楼2010-07-20 18:04:33
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xmc8362

银虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by 渔火江枫 at 2010-07-20 18:55:15:
我觉得MS中显示成键与否,应该是软件中有个阈值,小于它显示bond,大于它则不显示,似乎跟化学意义上成键没有必然联系。如果判断是否成键,还要看原子间的距离跟文献中或实验值是否相近。

谢谢!
我也是这么认为的。
可是上面两个C吸附的图示中结构参数几乎一样,但从模型建立开始就是一个图中C与Si未显示成键,而另外一个图中C与Si显示成键,优化后还是如此。好像不是简单的阈值问题。
MS中的“阈值”在哪里设置?

[ Last edited by xmc8362 on 2010-7-20 at 23:02 ]
4楼2010-07-20 22:59:45
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渔火江枫

金虫 (小有名气)

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zzy870720z(金币+2):谢谢指导 2010-07-22 20:00:59
引用回帖:
Originally posted by xmc8362 at 2010-07-20 22:59:45:

谢谢!
我也是这么认为的。
可是上面两个C吸附的图示中结构参数几乎一样,但从模型建立开始就是一个图中C与Si未显示成键,而另外一个图中C与Si显示成键,优化后还是如此。好像不是简单的阈值问题。
MS中的“ ...

在MS中有个Bond Cacluation工具,可以在build下拉菜单中找到,它可以调整成键的阈值
IdeasWorthSpreading!
5楼2010-07-22 16:34:50
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