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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » 【求助】Si(100)表面吸附成键问题
北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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xmc8362

银虫 (正式写手)

[交流] 【求助】Si(100)表面吸附成键问题 已有6人参与

计算Si(100)表面C的吸附，发现在顶位吸附时，一般计算后C与Si未显示成键；

而如果计算 CN 在 Si(100)表面顶位垂直吸附时（C在下），则显示N与Si成键（点击后呈黄色），而中间的C反而不成键。这样的结果合理吗？


[ Last edited by xmc8362 on 2010-7-19 at 21:50 ]
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1楼 2010-07-19 21:48:22
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xmc8362

银虫 (正式写手)
特别难理解的是，有的时候建模优化又显示成键！！


[ Last edited by xmc8362 on 2010-7-20 at 23:01 ]
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2楼2010-07-20 18:04:33
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渔火江枫

金虫 (小有名气)
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zzy870720z(金币+2):谢谢指点，MS确实存在这种情况，还是应该看成键信息，不应该根据图来判断 2010-07-20 19:15:31
hometownlove(金币+2):说得很有道理 2010-07-21 10:06:46
我觉得MS中显示成键与否,应该是软件中有个阈值,小于它显示bond,大于它则不显示，似乎跟化学意义上成键没有必然联系。如果判断是否成键，还要看原子间的距离跟文献中或实验值是否相近。
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3楼2010-07-20 18:55:15
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xmc8362

银虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by 渔火江枫 at 2010-07-20 18:55:15:
我觉得MS中显示成键与否,应该是软件中有个阈值,小于它显示bond,大于它则不显示，似乎跟化学意义上成键没有必然联系。如果判断是否成键，还要看原子间的距离跟文献中或实验值是否相近。

谢谢！
我也是这么认为的。
可是上面两个C吸附的图示中结构参数几乎一样，但从模型建立开始就是一个图中C与Si未显示成键，而另外一个图中C与Si显示成键，优化后还是如此。好像不是简单的阈值问题。
MS中的“阈值”在哪里设置？

[ Last edited by xmc8362 on 2010-7-20 at 23:02 ]
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4楼2010-07-20 22:59:45
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渔火江枫

金虫 (小有名气)
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zzy870720z(金币+2):谢谢指导 2010-07-22 20:00:59
引用回帖:
Originally posted by xmc8362 at 2010-07-20 22:59:45:

谢谢！
我也是这么认为的。
可是上面两个C吸附的图示中结构参数几乎一样，但从模型建立开始就是一个图中C与Si未显示成键，而另外一个图中C与Si显示成键，优化后还是如此。好像不是简单的阈值问题。
MS中的“ ...

在MS中有个Bond Cacluation工具，可以在build下拉菜单中找到，它可以调整成键的阈值
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5楼2010-07-22 16:34:50
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guolianshun

铜虫 (著名写手)
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Originally posted by xmc8362 at 2010-07-19 21:48:22:
计算Si(100)表面C的吸附，发现在顶位吸附时，一般计算后C与Si未显示成键；

而如果计算 CN 在 Si(100)表面顶位垂直吸附时（C在下），则显示 ...

可以问下目测没成键的可以优化后成键吗
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6楼2010-09-22 11:10:24
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wei.ji

木虫 (正式写手)
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C在Si上大概不太容易这么吸附吧？ 至少也是C在两个Si之间呀
引用回帖:
Originally posted by xmc8362 at 2010-07-19 21:48:22:
计算Si(100)表面C的吸附，发现在顶位吸附时，一般计算后C与Si未显示成键；

而如果计算 CN 在 Si(100)表面顶位垂直吸附时（C在下），则显示 ...

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http://sim.phys.ruc.edu.cn
7楼2010-09-22 15:45:26
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九尾鱼

木虫 (著名写手)
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aylayl08(金币+2):谢谢九尾鱼，中秋快乐 2010-09-22 19:24:41
Si的（100）非常敏感外界条件，很容易引起重构，你构造的1*1的面，直接吸附C原子，貌似不合理。
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8楼2010-09-22 16:00:33
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xmc8362

银虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by 九尾鱼 at 2010-09-22 16:00:33:
Si的（100）非常敏感外界条件，很容易引起重构，你构造的1*1的面，直接吸附C原子，貌似不合理。

常温下Si(100)面是否已经重构?
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9楼2010-09-24 16:03:35
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九尾鱼

木虫 (著名写手)
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cenwanglai(金币+2):谢谢回复 2010-09-24 19:51:34
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Originally posted by xmc8362 at 2010-09-24 16:03:35:

常温下Si(100)面是否已经重构?

具体Si表面怎么重构我没研究过，你可以找找文献，应该很多，我只是凭经验认为，因为半导体表面不像金属表面，半导体表面原子之间的键合包含了共价键的成分，所以轨道间杂化很强烈，所以外界环境一旦变化，很容易导致新的重构。
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10楼2010-09-24 16:12:44
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