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viplaji006

木虫 (小有名气)

[交流] 【求助】CASTEP 分子晶体建结构 已有6人参与

请教:

      我想用CASTEP算下富勒烯C70分子的电子能量损失谱(EELS)或者X射线吸收谱,目前面临一个问题。

      如何建结构,我知道一种最土的方法,就是直接建一个大的框把一个C70分子放到框的中间。但是这样非常的占用时间跟资源。(如果这种一个大框如果找出对称性的话,是不是计算效率也会提高很多啊 ?C60、C70的分子对称性还是挺高的)   请大牛指导下小弟。

       但是计算晶体的时候,如何建结构?老板大体说过如何去做,说要考虑分子的对称性 跟晶体的对称性,然后找出几个对称点来就可以解决。但是还是不知道如何搞,请教搞过人,或者群论高人。

Ps: 偶的群论很弱,白痴基本。    请教各位!

谢谢大家积极参入指导!
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Justdoit
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condensed

木虫 (著名写手)

★ ★ ★
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qasd(金币+2):谢谢 2010-07-18 17:58:30
1. 空间群
2. 晶格常数
3. 原子占位
2楼2010-07-18 16:54:31
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普通回帖

viplaji006

木虫 (小有名气)

我想知道是, 分子本分的对称性,跟晶体的对称性,怎么弄?
引用回帖:
Originally posted by condensed at 2010-07-18 16:54:31:
1. 空间群
2. 晶格常数
3. 原子占位

Justdoit
3楼2010-07-18 19:00:36
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carlaty

金虫 (正式写手)

★ ★ ★
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lvjian8596(金币+2):感谢交流! 2010-07-18 19:16:17
C60的晶体结构记得MS自带
你要用castep计算性质,必然把分子放到你所谓的大框中间
castep只能处理周期性结构
你可以试试,找个非三维周期性结构,哪怕是个表面,castep的run都是灰色的
4楼2010-07-18 19:08:26
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viplaji006

木虫 (小有名气)

自带的是分子结构啊。

周期性结构我也知道,所以才要建晶体。
引用回帖:
Originally posted by carlaty at 2010-07-18 19:08:26:
C60的晶体结构记得MS自带
你要用castep计算性质,必然把分子放到你所谓的大框中间
castep只能处理周期性结构
你可以试试,找个非三维周期性结构,哪怕是个表面,castep的run都是灰色的

Justdoit
5楼2010-07-18 19:24:54
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condensed

木虫 (著名写手)


hedaors(金币+1):Thanks 2010-07-19 15:22:38
引用回帖:
Originally posted by viplaji006 at 2010-07-18 19:00:36:
我想知道是, 分子本分的对称性,跟晶体的对称性,怎么弄?



分子晶体也是晶体啊...又没区别.
6楼2010-07-19 09:24:09
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viplaji006

木虫 (小有名气)

问题就再这里啊,只有单个的分子啊,没有晶体啊。
引用回帖:
Originally posted by condensed at 2010-07-19 09:24:09:


分子晶体也是晶体啊...又没区别.

Justdoit
7楼2010-07-19 10:06:28
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yjmaxpayne

木虫 (正式写手)

★ ★
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hedaors(金币+1):Thanks 2010-07-19 15:22:30
你试试看先用Discover,Forcite或者是Gulp这些经典力场模块对晶格进行优化(初始晶体可以是中间放一个C70的模型),之后再试着找找对称性, 能找到的话, 下一步就是使用Dmol或者是CASTEP对晶格进行进一步的优化, 或许就能得到你想要的结构了。
8楼2010-07-19 10:37:32
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viplaji006

木虫 (小有名气)

再次感谢。
引用回帖:
Originally posted by yjmaxpayne at 2010-07-19 10:37:32:
你试试看先用Discover,Forcite或者是Gulp这些经典力场模块对晶格进行优化(初始晶体可以是中间放一个C70的模型),之后再试着找找对称性, 能找到的话, 下一步就是使用Dmol或者是CASTEP对晶格进行进一步的优化, ...

Justdoit
9楼2010-07-20 10:15:42
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g_xq96

银虫 (小有名气)

C60的晶体结构记得MS自带


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引用回帖:
Originally posted by carlaty at 2010-07-18 19:08:26:
C60的晶体结构记得MS自带
你要用castep计算性质,必然把分子放到你所谓的大框中间
castep只能处理周期性结构
你可以试试,找个非三维周期性结构,哪怕是个表面,castep的run都是灰色的

C60的晶体结构记得MS自带,请问在MS中如何才能找到!谢谢!
山路十八弯http://blog.sina.com.cn/u/1589327057
10楼2010-08-31 14:39:21
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