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apollosun9283

金虫 (小有名气)

剑桥公爵

[求助] CASTEP和DMo3l做离子型晶体几何优化的问题

一般说来，做晶体的表面吸附，首先需要对晶体进行几何优化，然后切面建slab模型。
   为此，最开始我们需要查找待研究的晶体所属的空间群、晶格常数，这样建出来的晶体是有空间群性质限制的，即α、β、γ是固定的。
   现在有一下几个问题：
   其一，晶体建好以后，用CASTEP做几何优化，勾选optimize cell， 是不是优化后，a、b、c的数值会变，但是角度α、β、γ不会变呢？
   其二，晶体建好以后，Make P1，用CASTEP做几何优化，勾选optimize cell， 是不是优化后，不仅a、b、c的数值会变，而且角度α、β、γ也会变呢？
   其三，因为晶体几何优化会影响到后续的slab模型，那么用CASTEP做表面吸附时，晶体几何的几何优化，到底需不需要make P1呢？
   其四，有位同学告诉我，即使make P1后，角度α、β、γ(假设初始α=β=γ=90°)会变化，但是正确的几何优化结果，经过若干次迭代后，还是α=β=γ=90°，这个说法对吗？
   其五，用DMol3做几何优化，不勾选Use Symmetry做几何优化，是不是效果相当于make P1了？
   问题比较多，请大家帮帮忙！万分感谢！
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倚楼听风雨，淡看江湖路
1楼 2012-10-18 16:20:38
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updownupdown

铁虫 (初入文坛)
我也有同样的问题啊，同求解答。
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2楼2012-12-11 10:06:26
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zxynepu

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

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apollosun9283: 金币+100, ★★★★★最佳答案 2012-12-12 12:26:27
fzx2008: 金币+5, 谢谢指教！ 2012-12-12 12:48:35
其一，晶体建好以后，用CASTEP做几何优化，勾选optimize cell， 是不是优化后，a、b、c的数值会变，但是角度α、β、γ不会变呢？
答：用CASTEP对晶体进行几何优化，必须选中optimize cell。
若保持原有对称性不变的前提下，优化过程中，a、b、c的数值会发生改变并最终分别收敛到某值，但是在整个优化过程中角度α、β、γ保持不变。
其二，晶体建好以后，Make P1，用CASTEP做几何优化，勾选optimize cell， 是不是优化后，不仅a、b、c的数值会变，而且角度α、β、γ也会变呢？
答：若将晶胞对称性设为P1，则在优化过程中，a、b、c和α、β、γ的数值都会发生改变并最终分别收敛到某值，具体收敛程度及最终数值与计算精度和采用的优化函数等有关。
其三，因为晶体几何优化会影响到后续的slab模型，那么用CASTEP做表面吸附时，晶体几何的几何优化，到底需不需要make P1呢？
答：make P1的作用是降低晶胞的对称性，但是不改变晶胞的周期性。其目的是在优化过程中能够按能量最低原理找出晶胞中具体原子的最可能存在的由对称性决定的位置，所以选择make P1通常用于晶胞结构变化较大的情况（如掺杂、替换原子等）。
其四，有位同学告诉我，即使make P1后，角度α、β、γ(假设初始α=β=γ=90°)会变化，但是正确的几何优化结果，经过若干次迭代后，还是α=β=γ=90°，这个说法对吗？
答：该说法基本是准确的，但有些提法不严谨，“正确的几何优化结果”这种说法就不严谨，没有绝对正确，只有相对正确。
其五，用DMol3做几何优化，不勾选Use Symmetry做几何优化，是不是效果相当于make P1了？
答：基本相同。
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3楼2012-12-11 10:57:06
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fds329

荣誉版主 (文坛精英)

鱼大婶

优秀版主优秀版主优秀版主优秀版主
引用回帖:
3楼: Originally posted by zxynepu at 2012-12-11 10:57:06
其一，晶体建好以后，用CASTEP做几何优化，勾选optimize cell， 是不是优化后，a、b、c的数值会变，但是角度α、β、γ不会变呢？
答：用CASTEP对晶体进行几何优化，必须选中optimize cell。
若保持原有对称性不变 ...

学习了。
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4楼2012-12-11 17:30:23
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zhou_24

银虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by zxynepu at 2012-12-11 10:57:06
其一，晶体建好以后，用CASTEP做几何优化，勾选optimize cell， 是不是优化后，a、b、c的数值会变，但是角度α、β、γ不会变呢？
答：用CASTEP对晶体进行几何优化，必须选中optimize cell。
若保持原有对称性不变 ...

你好，我构建的是P(2x2)Fe(111)的三层模型，进行表面弛豫之后感觉里面的原子好乱，我并没有选择optimize cell，这是怎么回事？我想着是做表面吸附的，但添加完吸附分子时，进行表面优化怎么也是变得好乱。。求指导呀，多谢了。我用的是CASTEP
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5楼2015-04-24 15:18:39
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xxxxxxxfc

金虫 (正式写手)
optimize cell是abc和角度都要变化。你不想角度变的话，可以把角度锁住。
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6楼2015-05-06 16:47:39
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匿名

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匿名

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