| 查看: 3009 | 回复: 7 | ||||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | ||||
apollosun9283金虫 (小有名气)
剑桥公爵
|
[求助]
CASTEP和DMo3l做离子型晶体几何优化的问题
|
|||
|
一般说来，做晶体的表面吸附，首先需要对晶体进行几何优化，然后切面建slab模型。 为此，最开始我们需要查找待研究的晶体所属的空间群、晶格常数，这样建出来的晶体是有空间群性质限制的，即α、β、γ是固定的。 现在有一下几个问题： 其一，晶体建好以后，用CASTEP做几何优化，勾选optimize cell， 是不是优化后，a、b、c的数值会变，但是角度α、β、γ不会变呢？ 其二，晶体建好以后，Make P1，用CASTEP做几何优化，勾选optimize cell， 是不是优化后，不仅a、b、c的数值会变，而且角度α、β、γ也会变呢？ 其三，因为晶体几何优化会影响到后续的slab模型，那么用CASTEP做表面吸附时，晶体几何的几何优化，到底需不需要make P1呢？ 其四，有位同学告诉我，即使make P1后，角度α、β、γ(假设初始α=β=γ=90°)会变化，但是正确的几何优化结果，经过若干次迭代后，还是α=β=γ=90°，这个说法对吗？ 其五，用DMol3做几何优化，不勾选Use Symmetry做几何优化，是不是效果相当于make P1了？ 问题比较多，请大家帮帮忙！万分感谢！ |
回复此楼» 收录本帖的淘帖专辑推荐
 计算MS等 | 第一性学习 |
» 猜你喜欢
基金系统什么内容也没有
已经有6人回复
-
有多少人是今天查系统知道结果的？
已经有17人回复
-
国自然面上复盘~欢迎讨论
已经有12人回复
-
为什么资助数各大高校都创新高，自己申请怎么就这么难
已经有9人回复
-
售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急
已经有3人回复
-
哪位高人中了，把查询到的截图贴出来让我看看，让我长长见识
已经有6人回复
-
售SCI文章，我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急
已经有4人回复
-
面上合作单位盖章
已经有5人回复
-
导师吐槽：我怎么摊上了这么个极品研究生！
已经有7人回复
-
申请删除本帖
已经有7人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 调节castep对于晶体结构总能的计算
已经有6人回复
- CASTEP中如何计算晶体的价电子个数
已经有8人回复
- CASTEP对优化后的晶体进行分态密度分析，应该怎么操作
已经有14人回复
- CASTEP建模方法：虚拟晶体近似(VCA)
已经有498人回复
- MS 中的CASTEP可以计算强关联体系的晶体结构（如VO2)吗？
已经有7人回复
- 【求助】CASTEP 增加压强是晶体结构变化？如何设置？
已经有11人回复
- 【求助】CASTEP中怎样构建晶体聚合物呢？
已经有3人回复
- 【求助】用MS中的castep模块计算晶体
已经有12人回复
- 【求助】CASTEP 分子晶体建结构
已经有10人回复
- 【求助】CASTEP做Dynamic时晶体易变……
已经有12人回复
fds329
荣誉版主 (文坛精英)
鱼大婶
-
专家经验: +1536 - 应助: 207 (大学生)
- 贵宾: 6.842
- 金币: 59179.4
- 散金: 21817
- 红花: 261
- 沙发: 156
- 帖子: 46404
- 在线: 2171.7小时
- 虫号: 538323
- 注册: 2008-04-02
- 专业: 无机化学
- 管辖: 无机/物化
学习了。 4楼2012-12-11 17:30:23
updownupdown
铁虫 (初入文坛)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 6.5
- 帖子: 42
- 在线: 31.2小时
- 虫号: 1926159
- 注册: 2012-08-06
- 性别: GG
- 专业: 凝聚态物性 II ：电子结构
2楼2012-12-11 10:06:26
zxynepu
铁杆木虫 (正式写手)
- 应助: 21 (小学生)
- 金币: 6556.8
- 散金: 18
- 红花: 12
- 帖子: 314
- 在线: 442.9小时
- 虫号: 1107918
- 注册: 2010-09-26
- 性别: GG
- 专业: 金属材料的合金相、相变及
【答案】应助回帖
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ...
apollosun9283: 金币+100, ★★★★★最佳答案 2012-12-12 12:26:27
fzx2008: 金币+5, 谢谢指教！ 2012-12-12 12:48:35
apollosun9283: 金币+100, ★★★★★最佳答案 2012-12-12 12:26:27
fzx2008: 金币+5, 谢谢指教！ 2012-12-12 12:48:35
|
其一，晶体建好以后，用CASTEP做几何优化，勾选optimize cell， 是不是优化后，a、b、c的数值会变，但是角度α、β、γ不会变呢？ 答：用CASTEP对晶体进行几何优化，必须选中optimize cell。 若保持原有对称性不变的前提下，优化过程中，a、b、c的数值会发生改变并最终分别收敛到某值，但是在整个优化过程中角度α、β、γ保持不变。 其二，晶体建好以后，Make P1，用CASTEP做几何优化，勾选optimize cell， 是不是优化后，不仅a、b、c的数值会变，而且角度α、β、γ也会变呢？ 答：若将晶胞对称性设为P1，则在优化过程中，a、b、c和α、β、γ的数值都会发生改变并最终分别收敛到某值，具体收敛程度及最终数值与计算精度和采用的优化函数等有关。 其三，因为晶体几何优化会影响到后续的slab模型，那么用CASTEP做表面吸附时，晶体几何的几何优化，到底需不需要make P1呢？ 答：make P1的作用是降低晶胞的对称性，但是不改变晶胞的周期性。其目的是在优化过程中能够按能量最低原理找出晶胞中具体原子的最可能存在的由对称性决定的位置，所以选择make P1通常用于晶胞结构变化较大的情况（如掺杂、替换原子等）。 其四，有位同学告诉我，即使make P1后，角度α、β、γ(假设初始α=β=γ=90°)会变化，但是正确的几何优化结果，经过若干次迭代后，还是α=β=γ=90°，这个说法对吗？ 答：该说法基本是准确的，但有些提法不严谨，“正确的几何优化结果”这种说法就不严谨，没有绝对正确，只有相对正确。 其五，用DMol3做几何优化，不勾选Use Symmetry做几何优化，是不是效果相当于make P1了？ 答：基本相同。 |
3楼2012-12-11 10:57:06
5楼2015-04-24 15:18:39
30
投票:
