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【求助】CASTEP做Dynamic时晶体易变……已有4人参与
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本人课题与热力学等问题联系比较多，所以想用CASTEP中的Dynamic来求得不同晶体的热力学数据（关键是吉布斯函数）。 后来看到了小木虫计算版期刊第一期中wenhua luo和lei0736的《自由能的分子动力学计算》一文，开始按照里面的步骤学习使用Dynamic来模拟计算。 在内能模拟时，先从MS的数据库中直接导入了Ag，然后扩展到8x8x8的结构，再Make P1。然后按照文章中的步骤，选择NPT系综，每个时间步为2fs，温度为300K，然后开始计算。结果总是在进行几个时间步后就提示晶体易变，任务失败。 为了加快全流程速度，改为设置了10fs为一个时间步，共100时间步，Thermostat使用Nose，Barostat使用Andersen，并且为固定了质心（Fix center of mass）。并且为了增强收敛性，加大了截断能，并且使用了8x8x8的K点设置。采用LDA超软赝势进行计算，结果依然有错误提示： 顺便看了一下结果图，的确这个突变有点太那啥了……  由于是工科背景，对于赝势之类的理论比较空白，虽然在恶补，但是暂时依然杯水车薪。哪位高人可以帮忙指出一下，上面的那些步骤，都有哪些问题么…… |
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 有变化/波动到是不在乎，可是问题在于，这个错误提示：Error in md_vv1_npt_nose - cell inconsistency? Current trace stack: md_vv1_npt_nose md_run castep Error in md_vv1_npt_nose - cell inconsistency? Current trace stack: md_vv1_npt_nose md_run castep MPI Application rank 3 exited before MPI_Finalize() with status 1 这是失败后的castep文件的末尾显示的错误信息……偶就是不明白为什么总会有这么个信息…… 至于那两个图，是因为通过观察，有上述错误信息时，在Motion和Temp的两个图中，至少有一个会发生剧烈变化……不过，这个没关系，可以不care的说……重点还是在于为什么MD的计算会以cell inconsistency的问题失败…… |
7楼2010-04-28 13:20:44
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咋没人回帖了捏……8楼2010-04-28 17:17:55
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