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xyzmuch

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[交流] 【求助】castep建立晶体结构时出现孤立的原子是怎么回事已有3人参与

我按照构建空间群（Pmn21）、添加原子的顺序建立晶体结构后，用棒球式结构显示后，怎么发现有的原子是孤立的呢？

谢谢。

我又按照二楼的朋友重新进行了输入，并且rebuild了晶体，仍然如此。按照分子式不应该出现孤立的原子啊

感谢各位

[ Last edited by xyzmuch on 2010-4-30 at 16:37 ]

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1楼 2010-04-30 11:27:36

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qinyuan1598

铜虫 (小有名气)

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专业: 凝聚态物性 II ：电子结构

★ ★ ★ ★
xyzmuch(金币+1):谢谢参与
gavinliu7390(金币+3):谢谢参与！ 2010-05-01 14:37

从 Build 菜单中选择 Add Atom。此选项会打开 Add Atom对话框，也可以在 Atom and
Bond 工具栏上单击相应的按钮。
进入 Options栏，确认 Test for bonds as atoms are created 被选中。当该选项被选中的时
候，MS Modeling 会在晶体建造过程中，自动产生相应的键。MS Modeling 也有一个通用的
Bond Calculation 工具，可以从 Build 菜单中调用，该工具允许你选择、编辑并定义最佳的成
健方案。在本例中，默认值就已经足够了。
仍然在 Options 栏中，确认 Coordinatie System是 Fractional。进入到 Atoms 栏中，从
Element 下拉菜单中选择 Si，并输入相应的 a、b、c 数据。a=0.480781, b=0.480781, c=0.0。
Si 原子和其对称原子加入到晶胞内。
同样的，我们可以加入氧原子。氧原子的参数为 a=0.150179,b=0.414589,c=0.116499。氧
原子和其对称原子加入到晶胞内，程序会自动计算并加入相关的键。