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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » 【讨论】如何批量更改sybyl mol2分子格式的内部外部名称？
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bbslover

金虫 (正式写手)

[交流] 【讨论】如何批量更改sybyl mol2分子格式的内部外部名称？ 已有6人参与

如何批量更改sybyl mol2分子格式的内部外部名称？

开始使用chemdraw画分子的时候，都命名以数字开头的了，比如1.cdx 2.cdx  .... 200.cdx,现在做药效团叠合的时候不识别了，可能是分子名称不对，似乎分子命名时候以字母开头比较好，比如m1.cdx m2.cdx...m200.cdx,转化到mol2后，分子内部名称是1.cdx.mol2, 2.cdx.mol2, ...  200.cdx.mol2，我想把这200个分子批量改名内部外部都命名为m1.mol2, m2.mol2...m200.mol2，请问有什么办法可以批量更改这个数据库中的200各分子吗，或者更改包括多分子的sdf，multimol2文件都行，谢谢！一个一个命名太费时了。

谢谢！
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1楼 2010-07-05 14:48:21
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bbslover

金虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by yalefield at 2010-07-09 07:24:10:
在Windows系统下，打开文件目录，按照名称为文件排序；
然后，选中多个文件，但（在选中多个文件的情况下）只修改第一个文件，那么其他被选中的文件会自动按照次序命名。

例如，选中了A.mol, W.mol, X.mol, Y ...

多谢回答，但是更改的是文件的外部显示名称，内部的还是没有改变啊。比如，我的 101.mol2，要改为m101.mol2. 我重新命名之后，内部显示的还是101.mol2,内部没有改变，到sybyl中识别的是内部名称的。

#        Name:                        101
#        Creating user name:        hm
#        Creation time:                Thu Jul  8 02:37:16 2010

#        Modifying user name:        hm
#        Modification time:        Thu Jul  8 02:37:16 2010

@MOLECULE
101
   58    61     1     1     1
SMALL
GAST_HUCK
****
From 3DB ct
@ATOM
      1 C          -0.052516    0.333430   -0.461461 C.ar      1 <1>         0.131981
      2 C          -0.202692   -0.038602    0.878834 C.ar      1 <1>         0.107916
      3 C           0.936281   -0.092950    1.694546 C.ar      1 <1>         0.022827
      4 C           2.199129    0.136481    1.133930 C.ar      1 <1>         0.022908
      5 N           2.309747    0.414917   -0.181321 N.ar      1 <1>        -0.307302
      6 C           1.227881    0.556571   -0.972923 C.ar      1 <1>         0.021080
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7楼2010-07-11 12:19:13
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tjegg

铁杆木虫 (著名写手)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
lei0736(金币+1):谢谢 2010-07-09 20:21:53
你的是Linux版本吗？可以用vi编辑器来替换。
赞一下(2人) 回复此楼
除了你的亲人，没有人应该对你好，对你好的人，一定要珍惜。
3楼2010-07-09 06:51:32
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yalefield

金虫 (文坛精英)

老汉一枚
★ ★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
ghcacj(金币+4):谢谢 2010-07-09 09:17:47
在Windows系统下，打开文件目录，按照名称为文件排序；
然后，选中多个文件，但（在选中多个文件的情况下）只修改第一个文件，那么其他被选中的文件会自动按照次序命名。

例如，选中了A.mol, W.mol, X.mol, Y.mol
修改第一个A.mol为A (1).mol
那么，W.mol, X.mol, Y.mol会自动变为A (2).mol, A (3).mol和A (4).mol
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4楼2010-07-09 07:24:10
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tjegg

铁杆木虫 (著名写手)
楼上的真是大葱，我怎么没想到？看到差距了。
赞一下 回复此楼
除了你的亲人，没有人应该对你好，对你好的人，一定要珍惜。
5楼2010-07-09 18:35:07
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