应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » 【讨论】如何批量更改sybyl mol2分子格式的内部外部名称？
51/1返回列表
查看: 2151  |  回复: 13
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

bbslover

金虫 (正式写手)

[交流] 【讨论】如何批量更改sybyl mol2分子格式的内部外部名称？ 已有6人参与

如何批量更改sybyl mol2分子格式的内部外部名称？

开始使用chemdraw画分子的时候，都命名以数字开头的了，比如1.cdx 2.cdx  .... 200.cdx,现在做药效团叠合的时候不识别了，可能是分子名称不对，似乎分子命名时候以字母开头比较好，比如m1.cdx m2.cdx...m200.cdx,转化到mol2后，分子内部名称是1.cdx.mol2, 2.cdx.mol2, ...  200.cdx.mol2，我想把这200个分子批量改名内部外部都命名为m1.mol2, m2.mol2...m200.mol2，请问有什么办法可以批量更改这个数据库中的200各分子吗，或者更改包括多分子的sdf，multimol2文件都行，谢谢！一个一个命名太费时了。

谢谢！
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2010-07-05 14:48:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

bbslover

金虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by yalefield at 2010-07-09 07:24:10:
在Windows系统下，打开文件目录，按照名称为文件排序；
然后，选中多个文件，但（在选中多个文件的情况下）只修改第一个文件，那么其他被选中的文件会自动按照次序命名。

例如，选中了A.mol, W.mol, X.mol, Y ...

多谢回答，但是更改的是文件的外部显示名称，内部的还是没有改变啊。比如，我的 101.mol2，要改为m101.mol2. 我重新命名之后，内部显示的还是101.mol2,内部没有改变，到sybyl中识别的是内部名称的。

#        Name:                        101
#        Creating user name:        hm
#        Creation time:                Thu Jul  8 02:37:16 2010

#        Modifying user name:        hm
#        Modification time:        Thu Jul  8 02:37:16 2010

@MOLECULE
101
   58    61     1     1     1
SMALL
GAST_HUCK
****
From 3DB ct
@ATOM
      1 C          -0.052516    0.333430   -0.461461 C.ar      1 <1>         0.131981
      2 C          -0.202692   -0.038602    0.878834 C.ar      1 <1>         0.107916
      3 C           0.936281   -0.092950    1.694546 C.ar      1 <1>         0.022827
      4 C           2.199129    0.136481    1.133930 C.ar      1 <1>         0.022908
      5 N           2.309747    0.414917   -0.181321 N.ar      1 <1>        -0.307302
      6 C           1.227881    0.556571   -0.972923 C.ar      1 <1>         0.021080
赞一下 回复此楼
7楼2010-07-11 12:19:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 14 个回答

tjegg

铁杆木虫 (著名写手)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
lei0736(金币+1):谢谢 2010-07-09 20:21:53
你的是Linux版本吗？可以用vi编辑器来替换。
赞一下(2人) 回复此楼
除了你的亲人，没有人应该对你好，对你好的人，一定要珍惜。
3楼2010-07-09 06:51:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yalefield

金虫 (文坛精英)

老汉一枚
★ ★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
ghcacj(金币+4):谢谢 2010-07-09 09:17:47
在Windows系统下，打开文件目录，按照名称为文件排序；
然后，选中多个文件，但（在选中多个文件的情况下）只修改第一个文件，那么其他被选中的文件会自动按照次序命名。

例如，选中了A.mol, W.mol, X.mol, Y.mol
修改第一个A.mol为A (1).mol
那么，W.mol, X.mol, Y.mol会自动变为A (2).mol, A (3).mol和A (4).mol
赞一下(2人) 回复此楼
4楼2010-07-09 07:24:10
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

tjegg

铁杆木虫 (著名写手)
楼上的真是大葱，我怎么没想到？看到差距了。
赞一下 回复此楼
除了你的亲人，没有人应该对你好，对你好的人，一定要珍惜。
5楼2010-07-09 18:35:07
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 14 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +3 7K1CJE38xLG4 2026-08-25 3/150 2026-08-25 23:20 by cNXvBfCpiZOM
[基金申请] 今天务委会开完了，明天出结果吗 +17 angus9576 2026-08-25 21/1050 2026-08-25 22:39 by 悠悠美女
[基金申请] 在坚冰还盖着北海的时候，我看到了怒放的梅花。 (金币+10) +6 ziyangfang 2026-08-25 9/450 2026-08-25 20:26 by huagongfeihu
[基金申请] 有没有大神帮我看看基金代码 28+4 1234567wang 2026-08-24 10/500 2026-08-25 19:15 by lfy8008
[基金申请] 放榜前的不淡定 20+4 snowwithsea 2026-08-19 19/950 2026-08-25 17:57 by chick875
[基金申请] 某些机构，以效率低为荣，以效率低作为存在感 +9 yuleib84 2026-08-25 10/500 2026-08-25 17:14 by alexon
[基金申请] 2026国自然函评费到账 +20 羊腰板 2026-08-21 23/1150 2026-08-25 16:34 by zsna
[基金申请] 如果此刻你正在为国基感到焦虑，不妨来听听这首《基金之外》 +8 scalable 2026-08-24 8/400 2026-08-25 12:52 by jnhyjjm
[基金申请] 没有任何消息-是不是就凉了 +9 图啦图啦 2026-08-24 10/500 2026-08-25 11:59 by 南海小哥
[基金申请] 人气不行了 +11 fansofjerry 2026-08-21 11/550 2026-08-25 11:04 by 孤独的英雄6
[基金申请] 2026年的国家社科基金项目通讯评审的新规则与新动向、新挑战 +5 process2012 2026-08-23 7/350 2026-08-25 09:42 by huixian257
[基金申请] 今天基金会出结果吗？20260819 +17 kkkl_v 2026-08-19 18/900 2026-08-25 09:41 by windflowerwy
[基金申请] 我面上完蛋了 +13 且听虎啸 2026-08-20 14/700 2026-08-25 09:10 by mrkang
[基金申请] 只有每年这种时候来逛逛小木虫 +25 yaoyewhu2008 2026-08-20 27/1350 2026-08-25 08:01 by Equinoxhua
[基金申请] 能否退出参与的面上项目解除限项 +21 koalala 2026-08-24 24/1200 2026-08-24 19:25 by 家与远方
[基金申请] 让我中一个面上吧！ +13 大萍1987 2026-08-20 16/800 2026-08-24 10:23 by 太傻了
[基金申请] 时间戳今天，20号变了 +5 archvillain 2026-08-20 5/250 2026-08-22 06:12 by hui_daxiao
[基金申请] 时间戳又变了 +13 wuchongjun 2026-08-20 19/950 2026-08-21 17:21 by 紫杉醇
[基金申请] 应该是下周三26日公布了吧？ +4 哈哈蛤？ 2026-08-21 4/200 2026-08-21 10:58 by Vivilian
[基金申请] 基金啊基金 +4 longfie172 2026-08-20 4/200 2026-08-21 08:58 by mark mao
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭