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bbslover金虫 (正式写手)
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【讨论】如何批量更改sybyl mol2分子格式的内部外部名称？ 已有6人参与
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如何批量更改sybyl mol2分子格式的内部外部名称？ 开始使用chemdraw画分子的时候，都命名以数字开头的了，比如1.cdx 2.cdx .... 200.cdx,现在做药效团叠合的时候不识别了，可能是分子名称不对，似乎分子命名时候以字母开头比较好，比如m1.cdx m2.cdx...m200.cdx,转化到mol2后，分子内部名称是1.cdx.mol2, 2.cdx.mol2, ... 200.cdx.mol2，我想把这200个分子批量改名内部外部都命名为m1.mol2, m2.mol2...m200.mol2，请问有什么办法可以批量更改这个数据库中的200各分子吗，或者更改包括多分子的sdf，multimol2文件都行，谢谢！一个一个命名太费时了。 谢谢！ |
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6楼2010-07-09 20:13:35
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多谢回答，但是更改的是文件的外部显示名称，内部的还是没有改变啊。比如，我的 101.mol2，要改为m101.mol2. 我重新命名之后，内部显示的还是101.mol2,内部没有改变，到sybyl中识别的是内部名称的。 # Name: 101 # Creating user name: hm # Creation time: Thu Jul 8 02:37:16 2010 # Modifying user name: hm # Modification time: Thu Jul 8 02:37:16 2010 @ 101 58 61 1 1 1 SMALL GAST_HUCK **** From 3DB ct @ 1 C -0.052516 0.333430 -0.461461 C.ar 1 <1> 0.131981 2 C -0.202692 -0.038602 0.878834 C.ar 1 <1> 0.107916 3 C 0.936281 -0.092950 1.694546 C.ar 1 <1> 0.022827 4 C 2.199129 0.136481 1.133930 C.ar 1 <1> 0.022908 5 N 2.309747 0.414917 -0.181321 N.ar 1 <1> -0.307302 6 C 1.227881 0.556571 -0.972923 C.ar 1 <1> 0.021080 |
7楼2010-07-11 12:19:13
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小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
lei0736(金币+4):谢谢 2010-07-12 13:38:43
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
lei0736(金币+4):谢谢 2010-07-12 13:38:43
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用EditPlus（共享）或者CrimsonEditor（开源/免费）这样的文本编辑软件。 Edit菜单下，有类似Find in files之类的功能， 也就是对某目录下的多个文件的内容进行“查找、修改”。 一般是用于编程时，改变某个变量的名称，这个名称往往分布在多个源代码文件中。 如果是简单的“替换”，那还比较容易。 如果类似您这种情况，那还要用到“正则表达式” ------------ 有个取巧的办法： 即把 # Name: 1 替换为 # Name: m1 ----------- 话说回来，用文本编辑器，修改200个文件的内容，手工操作，10分钟而已。 |
8楼2010-07-11 14:24:28
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