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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 【求助/交流】测序只能测出一半！请大家帮忙分析下！
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iamzhihui

铁虫 (初入文坛)

[交流] 【求助/交流】测序只能测出一半！请大家帮忙分析下！ 已有11人参与

送去测序，测了两遍。都只测出前700bp，测序正确，而片段总长1400bp。blast后面的700bp，显示的是目的基因。请大家分析下，我们是否得到了基因片段？是测序出了问题，还是我们的问题？
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1楼 2010-06-14 09:33:59
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seahow

木虫 (著名写手)
iamzhihui(金币+1):谢谢帮助！ 2010-07-02 14:42:44
我觉得你得到了目的片段！ 因为酶切鉴定没有问题。

测序不同多半是GC问题，呵呵。
建议你反向测序，或者设计新引物吧。

gooooooooood luck
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2楼2010-06-14 10:30:46
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lixg

铁杆木虫 (正式写手)
iamzhihui(金币+1):谢谢帮助！ 2010-07-02 14:43:14
进行双向测序
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3楼2010-06-14 10:40:54
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fascinating

银虫 (正式写手)
★
1949stone(金币+1):可以达到一千一后的 你说的也有道理 2010-06-14 13:13:16
iamzhihui(金币+1):谢谢帮助！ 2010-07-02 14:43:18
你是怎么测的 单向测了两次还是测的双向，1.4K的片段单向是测不完的呀，只能测6 ，7 百左右，你让公司直接测通就好了吧
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4楼2010-06-14 10:42:47
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张力民1598

铜虫 (小有名气)
iamzhihui(金币+1):谢谢帮助！ 2010-07-02 14:43:23
用通用引物测通即可
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5楼2010-06-14 11:44:33
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iamzhihui

铁虫 (初入文坛)

测序测通

两次测序是要求测通的，但是拿到的都是前面700bp片段，前面的全部比对正确。但是后面的就不吻合了。有没有可能是中间缺失一段呢？麻烦大家帮忙分析下。
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6楼2010-06-14 11:48:59
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jasco

木虫 (正式写手)
iamzhihui(金币+1):谢谢帮助！ 2010-07-02 14:43:31
引用回帖:
Originally posted by iamzhihui at 2010-06-14 11:48:59:
两次测序是要求测通的，但是拿到的都是前面700bp片段，前面的全部比对正确。但是后面的就不吻合了。有没有可能是中间缺失一段呢？麻烦大家帮忙分析下。

那就自己根据已经测序验证的片段设计一条引物，再送测
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7楼2010-06-14 11:56:30
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langrenshouji

铜虫 (小有名气)
测序好像目前是只有7~800啊，多了就不准了！
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8楼2010-06-14 13:57:30
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小白兄

金虫 (小有名气)
★
amisking(金币+1):good！ 2010-06-14 20:08:23
你可以在第一次比对正确结果的基础上叫测序公司设计引物步移一个反应再看看。如果你前面用的双向通用引物测序的，可以自己或者让公司帮你拼接下，看有没测通，或者是缺失片段。
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时光如流水，匆匆而过。
9楼2010-06-14 15:38:45
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wywangying169

银虫 (小有名气)
测序只能测800bp左右，你有1.4Kbp那么长，必须要测双向！
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好好自学，好好工作
10楼2010-06-23 16:15:55
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