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【求助】namd计算键能 已有2人参与
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通过NAMD计算单个分子（不是蛋白质，只是简单的有机小分子）的键能等参数，如何实现？ MS中的模型可以被NAMD调用么？ 谢谢！ |
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4楼2010-05-24 10:49:02
bay__gulf
金虫 (著名写手)
刘苏州
- 模拟EPI: 8
- 应助: 9 (幼儿园)
- 贵宾: 4.85
- 金币: 2332.8
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- 帖子: 1344
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- 专业: 理论和计算化学
- 管辖: 分子模拟
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binkwei(金币+10): 2010-05-21 09:06:32
ghcacj(金币+3):谢谢 2010-05-21 09:26:06
binkwei(金币+10): 2010-05-21 09:06:32
ghcacj(金币+3):谢谢 2010-05-21 09:26:06
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不知道你算键能还是键参数 前者namd 不能算, 这个量没有严格的意义 后者可以用Gaussian+paratool 或 Spartan 得到 参考 http://www.mdbbs.org/thread-16875-1-1.html MS中的模型可以被NAMD调用么？ ======= 可以, 但异常复杂 |
2楼2010-05-21 08:42:31
 [ Last edited by binkwei on 2010-5-24 at 10:49 ] |
3楼2010-05-21 09:03:28