| 查看: 624 | 回复: 3 | |||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | |||
[交流]
【求助】namd计算键能 已有2人参与
|
|||
|
通过NAMD计算单个分子（不是蛋白质，只是简单的有机小分子）的键能等参数，如何实现？ MS中的模型可以被NAMD调用么？ 谢谢！ |
回复此楼» 猜你喜欢
288求调剂
已经有6人回复
-
复试调剂
已经有12人回复
-
计算机11408，286分求调剂
已经有3人回复
-
材料专硕322分
已经有8人回复
-
一志愿上海海洋大学083200食品学硕，求调剂，接受其他专业083200
已经有5人回复
-
081200-11408-276学硕求调剂
已经有5人回复
-
材料调剂
已经有10人回复
-
313求调剂
已经有7人回复
-
304求调剂（085602，过四级，一志愿985）
已经有14人回复
-
材料工程302分求调剂
已经有7人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 我们课题组招聘，MD 模拟方面——最好精于NAMD gromacs 做生物分子模拟
已经有55人回复
- 如何计算键偶极距
已经有13人回复
- 【求助】键能的计算
已经有3人回复
- 【求助】在NAMD运行中使用CHARMM格式的力场文件，但力场参数来自AMBER力场，会出问题�
已经有4人回复
- 【求助】【如何计算H-H的键能与键长之间的关系】
已经有6人回复
- 【求助】Gromacs和NAMD比Amber快很多吗？如何选择？
已经有7人回复
- 【求助】ms怎么计算键能
已经有14人回复
- 【求助】哪个软件比较适合模拟纳米通道中的离子输运现象
已经有16人回复
- 【求助】化学键键能计算的求助
已经有5人回复
- 【求助】NAMD和Gromacs哪个简单？
已经有5人回复
- 【求助】化学反应键能计算
已经有15人回复
- 【在线答疑】关于NAMD/VMD
已经有210人回复
 [ Last edited by binkwei on 2010-5-24 at 10:49 ] |
3楼2010-05-21 09:03:28
bay__gulf
金虫 (著名写手)
刘苏州
- 模拟EPI: 8
- 应助: 9 (幼儿园)
- 贵宾: 4.85
- 金币: 2332.8
- 红花: 1
- 帖子: 1344
- 在线: 271小时
- 虫号: 592012
- 注册: 2008-09-03
- 专业: 理论和计算化学
- 管辖: 分子模拟
★ ★ ★
binkwei(金币+10): 2010-05-21 09:06:32
ghcacj(金币+3):谢谢 2010-05-21 09:26:06
binkwei(金币+10): 2010-05-21 09:06:32
ghcacj(金币+3):谢谢 2010-05-21 09:26:06
|
不知道你算键能还是键参数 前者namd 不能算, 这个量没有严格的意义 后者可以用Gaussian+paratool 或 Spartan 得到 参考 http://www.mdbbs.org/thread-16875-1-1.html MS中的模型可以被NAMD调用么？ ======= 可以, 但异常复杂 |
2楼2010-05-21 08:42:31
4楼2010-05-24 10:49:02
