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zj0726

铜虫 (小有名气)

[交流] 【求助/交流】RT-PCR 已有4人参与

大家做RT-PCR时,RNA加多少?CDNA加多少呀?最近做RT-PCR,结果老是不很理想,P出来的条带不亮,不知道是哪出了问题,请高手们指点一下
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zhwenxing

木虫 (著名写手)

尛森蟲

★ ★ ★
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1949stone(金币+2):很热心 很细致 2010-05-19 18:44:18
烦请楼主将问题说得清楚一些,具体的实验步骤如何做的,大家才能各抒己见哈。O(∩_∩)O哈哈~

1、您是一步法还是两步法?一步法的话,考虑RNA的纯度问题,还有反应体系的精确性。两步法的话,先反转录,根据不同的逆转录酶的要求去考量RNA的用量。

2、如果您用的是总RNA的话,比如promega的m-mlv,那么,25ul的反应体系,需要加入量为2-3ug,酶的用量为200U,如果用AMV的话,需要25U就足够了,但是其内切酶活性等均会升高。自己根据酶的性质来确定。

3、如果用mRNA作为反转录的模板会好很多,不知您是否需要纯化mRNA。

4、扩增如Actin之类的基因检测反转录的结果并不能准确的定量反转录的效率。

……
2楼2010-05-19 17:46:40
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zj0726

铜虫 (小有名气)

1949stone:表述明白了 虫友就可以更好的提供帮助了 2010-05-19 18:44:55
我是做半定量的RT-PCR。用两步法做的,先用总RNA反转录成CDNA ,用的是TAKARA的RNA PCR Kit(AMV)Ver.3.0,按照说明书做的10ul体系,然后再用1ul的CDNA做25ul体系的PCR反应(35个循环)。现在是内参也不是很亮
3楼2010-05-19 17:53:30
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skywalkerelf

银虫 (小有名气)

★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
哥们你的引物特异性不好!普通PCR验证一下你的目的引物和内参引物!
4楼2010-05-21 09:06:47
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liyong1981

金虫 (正式写手)


★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
帮你顶一下~
5楼2010-05-21 09:42:21
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zj0726

铜虫 (小有名气)

内参引物是用师姐的,我看她P的还不错呢
6楼2010-05-21 14:43:13
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