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dqvictory

铁虫 (小有名气)

[交流] 【求助/交流】以连接产物做模板扩增此连接产物,有问题请教各位达人~麻烦您帮忙分析下已有6人参与

各位虫友:
      你们好!我这一阶段的实验是先pcr扩增出三条不同的DNA片段(都加了酶切位点),回收,酶切后再回收,用T4DNA连接酶16度连接16个小时,然后以此三段连接产物为模板,用第一个片段的正向引物和第三个片段的反向引物作为引物,扩增这个连接产物。但总得不到理想的结果,非特异性条带较多,目的条带不亮,而且有时没有。请各位帮帮忙分析下!不胜感激!!!
      引物合成报告单上这两个引物的退火温度都是59.1度;G+C含量都是66.7%。连接产物的长度约2200bp。20μl的体系:模板6μl;引物分别2μl;Taq Master Mix 10μl。条件:93度2min;93度30s,58度45s,72度5min,32个循环;72度8min。
      谢谢啦!
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阿娇

金虫 (正式写手)

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
1949stone(金币+1):谢谢交流 2010-05-09 17:32:10
模板和引物量都太多,估计这就是非特异性带多的原因。
2楼2010-05-09 17:26:18
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dqvictory

铁虫 (小有名气)

哦~谢谢啦!我减少模板和引物量再试试看
把记忆随身携带!
3楼2010-05-09 18:50:00
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liudeng821111

木虫 (正式写手)

提高退火温度
4楼2010-05-09 21:12:33
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yzuxhq368

金虫 (小有名气)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
模板浓度不一定要减少,因为连接产物中连上的不会太多,引物可以减少。72度5分钟挺长的。另外,我是做两个片段连接,用femantas的T4酶,发现16度过夜连不如出22度4-6小时效率高。我用22度4小时后做PCR虽然杂条带多,但目的条带挺亮的。
5楼2010-05-09 21:44:19
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yujiaping1

木虫 (著名写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
退火温度要升高,另外引物浓度多少啊?
6楼2010-05-09 21:48:38
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dqvictory

铁虫 (小有名气)

非常感谢各位虫友,谢谢你们啦!
把记忆随身携带!
7楼2010-05-09 21:57:21
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临风7071

木虫 (正式写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
连到载体上在转到大肠杆菌中扩增,然后在酶切下来,这样比你的PCR好多了,而且应该不会有很多问题出现的,毕竟PCR有好多条件要去摸索
8楼2010-05-09 21:58:06
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dqvictory

铁虫 (小有名气)

引物浓度是10μM
把记忆随身携带!
9楼2010-05-09 22:04:48
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dqvictory

铁虫 (小有名气)

我做过把这三个片段连到T载体(PMD-18)上的,也没成功过,蛮郁闷的
把记忆随身携带!
10楼2010-05-09 22:12:02
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