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Yakamoz325银虫 (小有名气)
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[交流]
【求助/交流】关于使用AFLP的方法做遗传多样性的研究的几个问题 已有9人参与
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大家好,我是分子生物学菜鸟,以前没有做过相关的研究 我现在想做一种植物的遗传多样性,大约有10个样点,每个样点采样50个,这样算来也就是说共有500个样,如果用AFLP的方法来做,大约需要多少钱呢? 此外,是不是有AFLP的试剂盒卖,用试剂盒是不是要比常规的AFLP方法贵很多呢? 谢谢大家了。 盼大家指点。 小木虫上的朋友向来热情,希望今天的帖子有人回复啊! 万分感谢! |
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Yakamoz325(金币+10): 2010-04-28 18:21
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AFLP的实验我们做了4年,可以和你交流下经验。如果你是首次做AFLP,实验室基础决定你的预算。 1.仪器 建议用伯乐的产品。我们用的是:伯乐sequencing cell。一套配下来估计(30万),其中梳子和垫片很重要。 优点是:操作简便,特别是灌胶,制胶的过程。 2.相关试剂 首先玻璃板和托盘。一般准备100-200个就够了,注意规格。我们的是56×38的(cm);固定、漂洗、染色、脱色用的托盘要按照你玻璃板的规格而定,操作方便,不能太小也不能太大,太小,不便操作;太大,摇床的功率是问题。估计总共(700元) 其次试剂,AFLP所用是试剂很多,要注意的是:尿素的质量;其他的药品Acr&Bis、M剥离硅烷、亲和硅烷、溴芬蓝和二甲苯氰FF、TEMED、硼酸、甲醛、冰醋酸、无水碳酸钠、硫代硫酸钠、硝酸银均按照技术指导就可以用。(1500) 第三PCR,这个就是根据你的需要了。我们用的如下:Tris、EDTA、β-巯基乙醇、PVP、CTAB、水饱和酚、MseI、EcoRI、T4 DNA连接酶、MseI adapter、EcoRI adapter、琼脂糖、Taq聚合酶、dNTP 、 Marker;引物的数量,一般是16×16组合的。(4000) 以上说的就是从DNA提取到、酶切、连接、PCR、银染整个过程用的药品和具体的花费。如果实验室有的话能节约很多,如果没有就要买了。 建议:用一次的试剂就“借”;消耗品都是些化学试剂,便宜;DD水的质量和数量不可小看。 3实验设计 不知道LZ 是做什么的,我们做的是资源方面的所以工作量很大,引物数和样品数决定决定你的预算。500个样,一个引物组合理想的话要跑(不同规格47、73、96)8板。我们一般一人一天4个板,人力成本就少,如果你一个人做,会高。 可以这样说,AFLP一板的成本(含人工)80左右(前提是实验室基础好),实验过程长比较辛苦。 经验交流,拍砖勿狠。 |

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19楼2010-05-23 22:18:41







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