24小时热门版块排行榜    

查看: 752  |  回复: 0

jglee646

金虫 (小有名气)

[交流] 【求助】VASP计算出错,求解!

计算刚开始,到这步出错了,程序自动结束,求助!
WARNING: wrap around error must be expected set NGX to 182
WARNING: wrap around error must be expected set NGY to 110
WARNING: wrap around error must be expected set NGZ to  74

parallel 3dFFT wavefunction:
    minimum data exchange during FFTs selected (reduces bandwidth)
parallel 3dFFT charge:
    minimum data exchange during FFTs selected (reduces bandwidth)
   
错误信息如下:
forrtl: severe (174): SIGSEGV, segmentation fault occurred
Image              PC                Routine            Line        Source            
vaspmpi            000000000066DA44  Unknown               Unknown  Unknown
vaspmpi            000000000066D719  Unknown               Unknown  Unknown
vaspmpi            0000000000654F13  Unknown               Unknown  Unknown
vaspmpi            0000000000654D0C  Unknown               Unknown  Unknown
vaspmpi            000000000041C1F5  Unknown               Unknown  Unknown
vaspmpi            0000000000404C82  Unknown               Unknown  Unknown
libc.so.6          0000003DBBC1D8A4  Unknown               Unknown  Unknown
vaspmpi            0000000000404BA9  Unknown               Unknown  Unknown

编译器是intel fortran 10.1.015, mkl 10.0.3.020,编译过程是按照 intel官方的说明,http://software.intel.com/en-us/ ... -intel-mkl-in-vasp/,一步步来的。

.bash_profile文件如下:

# Intel Compiler
. /hptc_cluster/intel/fce/10.1.015/bin/ifortvars.sh
. /hptc_cluster/intel/cce/10.1.015/bin/iccvars.sh
. /hptc_cluster/intel/idbe/10.1.015/bin/idbvars.sh

# Intel MKL
. /hptc_cluster/intel/mkl/10.0.3.020/tools/environment/mklvarsem64t.sh
export LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH:/hptc_cluster/intel/mkl/10.0.3.020/lib/em64t

PATH=/hptc_cluster/intel/fce/10.1.015/bin:/hptc_cluster/intel/cce/10.1.015/bin:/hptc_cluster/intel/idbe/10.1.015/bin:/hptc_cluster/intel/mkl/10.0.3.020/tools/environment:$PATH

# VASP 4.6
export LD_LIBRARY_PATH=/hptc_cluster/intel/fce/10.1.015/lib:$LD_LIBRARY_PATH:/usr/local/lib:/usr/lib:/usr/lib64:/lib:/lib64:/hptc_cluster/intel/mkl/10.0.3.020/lib/em64t:/hptc_cluster/intel/impi/3.1/lib64

# MPI
PATH=/hptc_cluster/intel/impi/3.1/bin64:$PATH


makefile文件如下:

FFLAGS = -I/hptc_cluster/intel/mkl/10.0.3.020/include/fftw -FR -lowercase

# mkl.5.2 requires also to -lguide library
# set -DRPROMU_DGEMV  -DRACCMU_DGEMV in the CPP lines
BLAS=-L/hptc_cluster/intel/mkl/10.0.3.020/lib/em64t -lmkl_intel_lp64 -lmkl_sequential -lmkl_core -lpthread

# use the mkl Intel lapack
LAPACK=-L/hptc_cluster/intel/mkl/10.0.3.020/lib/em64t -lmkl_intel_lp64  -lmkl_sequential -lmkl_core -lpthread

FC=/hptc_cluster/intel/impi/3.1/bin64/mpiifort
FCL=$(FC)

# fftw.3.0 is slighly faster and should be used if available
FFT3D   = fftmpiw.o fftmpi_map.o fft3dlib.o   /hptc_cluster/intel/mkl/10.0.3.020/lib/em64t/libfftw3xf_intel.a
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

智能机器人

Robot (super robot)

我们都爱小木虫

相关版块跳转 我要订阅楼主 jglee646 的主题更新
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 面上合作单位盖章 +5 ssyjh 2026-08-27 5/250 2026-08-27 20:50 by gdfollow
[基金申请] 为什么资助数各大高校都创新高,自己申请怎么就这么难 +8 Kittylucky 2026-08-27 8/400 2026-08-27 18:33 by raiy123
[基金申请] 基金未中,这种答复是模板吗? +5 zhaosm1982 2026-08-27 6/300 2026-08-27 16:00 by lfy8008
[基金申请] 看板上这么多中的,有点像50人群里49个人都是骗子的那种感觉…… +5 a089 2026-08-26 6/300 2026-08-27 14:05 by jonewore
[基金申请] 怎么看青基中了没有啊 +5 叶九微 2026-08-26 5/250 2026-08-27 10:35 by l_zh2008
[文学芳草园] 梦想 +3 myrtle 2026-08-26 3/150 2026-08-27 10:01 by angelyueyi
[基金申请] 范进中举一文的中心思想 +9 炎黄贵胄 2026-08-22 10/500 2026-08-26 15:40 by semaglutide
[基金申请] 2026国自然函评费到账 +22 羊腰板 2026-08-21 25/1250 2026-08-26 15:00 by zuocuiping
[基金申请] 能否退出参与的面上项目解除限项 +23 koalala 2026-08-24 26/1300 2026-08-26 14:29 by 宝贝虫子
[基金申请] 出来了 +9 trojank 2026-08-26 9/450 2026-08-26 14:25 by 宝贝虫子
[基金申请] 哪位高人中了,把查询到的截图贴出来让我看看,让我长长见识 +4 yuleib84 2026-08-26 5/250 2026-08-26 13:40 by yuleib84
[基金申请] 国际合作可查了,中了面上 (EPI+1)(金币+50) +18 Ldrop2023 2026-08-26 18/900 2026-08-26 11:15 by cmrandy
[基金申请] 系统进不去 +4 yanglien 2026-08-26 5/250 2026-08-26 11:10 by wenfengw83
[基金申请] 国合可查了 +3 paperzjh 2026-08-26 3/150 2026-08-26 10:41 by LemmonTr
[基金申请] 今天务委会开完了,明天出结果吗 +19 angus9576 2026-08-25 23/1150 2026-08-26 10:03 by zp519
[基金申请] 明天应该可查了!? +6 chengyan1220 2026-08-23 6/300 2026-08-25 19:45 by zfd97
[基金申请] 如果此刻你正在为国基感到焦虑,不妨来听听这首《基金之外》 +8 scalable 2026-08-24 8/400 2026-08-25 12:52 by jnhyjjm
[基金申请] 我面上完蛋了 +13 且听虎啸 2026-08-20 14/700 2026-08-25 09:10 by mrkang
[教师之家] 跳槽后在研项目怎么办? +5 简单化xn 2026-08-22 10/500 2026-08-23 12:38 by 简单化xn
[基金申请] 基金啊基金 +4 longfie172 2026-08-20 4/200 2026-08-21 08:58 by mark mao
信息提示
请填处理意见