应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 【讨论】初始构象对优化结果的影响
51/1返回列表
查看: 878  |  回复: 8
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

kekexiliwolf

金虫 (正式写手)

小屁虫

[交流] 【讨论】初始构象对优化结果的影响 已有5人参与

想问一下同一个分子的不同构象优化后的结果是不是不一样？我对一个分子进行scan后从PES上找到了几个最低点，现在想知道对这几个最低点优化后会是同一个结果还是会不同呢，请前辈们指教
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
我们在为了文章而搞科研
1楼 2010-04-21 21:08:33
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

quantumor

金虫 (著名写手)

快乐兔子
★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
aylayl08(金币+2):谢谢讨论 2010-04-22 20:58
如果你的分子含有环，择优化不会很费事；若不含环，那你的SCAN 本身可能就有问题，因为那么多的可能性一般难以SCAN清楚的，优化的构象会很多的。在这种情况下要学会抓主要矛盾，搞几个主要的进行优化，否则，就只有耗时间和耐性了。
赞一下(2人) 回复此楼
愿好运与快乐伴随你！
6楼2010-04-22 11:56:39
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 9 个回答

fooo

金虫 (正式写手)
★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
zhou2009(金币+2): 2010-04-22 08:16
这个问题不好回答。对于类似于氨基酸的时候、生物分子而言，往往存在多个构象，所以从PES上的几个最低点优化，最后未必优化到同一点。但对于小的无机分子，优化到同一点的可能性相对会大一点。
引用回帖:
Originally posted by kekexiliwolf at 2010-04-21 21:08:33:
想问一下同一个分子的不同构象优化后的结果是不是不一样？我对一个分子进行scan后从PES上找到了几个最低点，现在想知道对这几个最低点优化后会是同一个结果还是会不同呢，请前辈们指教

赞一下(2人) 回复此楼
2楼2010-04-22 02:08:49
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hzfish

金虫 (正式写手)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
zhou2009(金币+1): 2010-04-22 08:57
引用回帖:
Originally posted by kekexiliwolf at 2010-04-21 21:08:33:
想问一下同一个分子的不同构象优化后的结果是不是不一样？我对一个分子进行scan后从PES上找到了几个最低点，现在想知道对这几个最低点优化后会是同一个结果还是会不同呢，请前辈们指教

用你能想到初始构象作为初始结构优化下就知道啦。

我见到过有人计算氨基酸的构象好象是一万多种，记不太清楚。实际找到了几百种。大分子打构象不是很找啊。
赞一下(2人) 回复此楼
3楼2010-04-22 08:19:24
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

kekexiliwolf

金虫 (正式写手)

小屁虫
引用回帖:
Originally posted by fooo at 2010-04-22 02:08:49:
这个问题不好回答。对于类似于氨基酸的时候、生物分子而言，往往存在多个构象，所以从PES上的几个最低点优化，最后未必优化到同一点。但对于小的无机分子，优化到同一点的可能性相对会大一点。


谢谢指教，那我试试吧，我的是一个20个C左右的有机分子
赞一下 回复此楼
我们在为了文章而搞科研
4楼2010-04-22 08:45:54
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 9 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 咱们一起用铁证分析2026国家社科基金中标与否 +3 启萌科技 2026-08-12 10/500 2026-08-13 20:42 by hmhminy
[基金申请] 静等基金结果 +8 gjjjzhong 2026-08-10 21/1050 2026-08-13 17:56 by 且听虎啸
[基金申请] FileCode能看出啥？ +10 要乐观耀哥 2026-08-10 28/1400 2026-08-13 17:51 by 医学老男孩
[基金申请] 分享一下我之前已中青C的计划书的filecode +4 布布和一二 2026-08-11 5/250 2026-08-13 12:56 by cratir
[基金申请] 关于Filecode分析方法 +9 majunge000 2026-08-10 11/550 2026-08-13 10:40 by ZH远山
[基金申请] 我的国基提前知道中了，可是同事的操作让我实在接受不了，怎么会有这样的人 +9 家与远方 2026-08-10 14/700 2026-08-13 09:41 by 臭臭不臭01
[基金申请] 结合人工智能，周易传统文化，filecode打分制来了，3分以上希望很大。 +3 Tide man 2026-08-12 4/200 2026-08-13 08:35 by ZJTJZ
[基金申请] 2019年青年基金涵评意见，大家看看几个A，几个B? +11 Tide man 2026-08-11 11/550 2026-08-13 07:35 by 撸猫猫
[论文投稿] 职称评审，求友友推荐见刊最快的期刊 +4 工厂打螺丝 2026-08-08 4/200 2026-08-12 09:18 by hansi2025
[基金申请] 是这周出结果还是下周出结果？ +3 yuleib84 2026-08-11 3/150 2026-08-11 21:53 by jnhyjjm
[基金申请] 帮忙看看fileCode +7 wwncly 2026-08-10 13/650 2026-08-11 19:36 by 冰心玉壶晴
[硕博家园] 读博的好处 +3 lnee 2026-08-11 3/150 2026-08-11 18:10 by 希望我好好的
[基金申请] 确定了，国自然21号放榜 +6 布布和一二 2026-08-10 7/350 2026-08-10 19:15 by 2000zf36392
[基金申请] 关于代码变化问题，想知道的进来 +17 且听虎啸 2026-08-07 24/1200 2026-08-10 18:35 by zhangduo2008
[基金申请] 据悉今年马上要出结果了 +7 瞬息宇宙 2026-08-10 8/400 2026-08-10 12:42 by Vivilian
[基金申请] 这样的filecode谁见过 +11 布布和一二 2026-08-08 22/1100 2026-08-10 11:10 by wmfsnow
[基金申请] 国基金的申报应该改成非等额制，评价高的钱多评价低的钱少，但是增加资助率 +7 a089 2026-08-07 7/350 2026-08-08 18:05 by gltch
[基金申请] 关于filecode +4 布布和一二 2026-08-07 7/350 2026-08-07 22:55 by zhanghaozhu
[基金申请] 化学口download_prp&fileCode的固定段好像这几天一直没变，有变的大神么？ +3 Tide man 2026-08-07 4/200 2026-08-07 22:39 by Tide man
[基金申请] filecode变化情况 +6 布布和一二 2026-08-07 22/1100 2026-08-07 14:45 by 且听虎啸
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭