应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 【讨论】初始构象对优化结果的影响
51/1返回列表
查看: 740  |  回复: 8
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

kekexiliwolf

金虫 (正式写手)

小屁虫

[交流] 【讨论】初始构象对优化结果的影响 已有5人参与

想问一下同一个分子的不同构象优化后的结果是不是不一样？我对一个分子进行scan后从PES上找到了几个最低点，现在想知道对这几个最低点优化后会是同一个结果还是会不同呢，请前辈们指教
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
我们在为了文章而搞科研
1楼 2010-04-21 21:08:33
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

kekexiliwolf

金虫 (正式写手)

小屁虫
引用回帖:
Originally posted by fooo at 2010-04-22 02:08:49:
这个问题不好回答。对于类似于氨基酸的时候、生物分子而言，往往存在多个构象，所以从PES上的几个最低点优化，最后未必优化到同一点。但对于小的无机分子，优化到同一点的可能性相对会大一点。


谢谢指教，那我试试吧，我的是一个20个C左右的有机分子
赞一下 回复此楼
我们在为了文章而搞科研
4楼2010-04-22 08:45:54
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 9 个回答

fooo

金虫 (正式写手)
★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
zhou2009(金币+2): 2010-04-22 08:16
这个问题不好回答。对于类似于氨基酸的时候、生物分子而言，往往存在多个构象，所以从PES上的几个最低点优化，最后未必优化到同一点。但对于小的无机分子，优化到同一点的可能性相对会大一点。
引用回帖:
Originally posted by kekexiliwolf at 2010-04-21 21:08:33:
想问一下同一个分子的不同构象优化后的结果是不是不一样？我对一个分子进行scan后从PES上找到了几个最低点，现在想知道对这几个最低点优化后会是同一个结果还是会不同呢，请前辈们指教

赞一下(2人) 回复此楼
2楼2010-04-22 02:08:49
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hzfish

金虫 (正式写手)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
zhou2009(金币+1): 2010-04-22 08:57
引用回帖:
Originally posted by kekexiliwolf at 2010-04-21 21:08:33:
想问一下同一个分子的不同构象优化后的结果是不是不一样？我对一个分子进行scan后从PES上找到了几个最低点，现在想知道对这几个最低点优化后会是同一个结果还是会不同呢，请前辈们指教

用你能想到初始构象作为初始结构优化下就知道啦。

我见到过有人计算氨基酸的构象好象是一万多种，记不太清楚。实际找到了几百种。大分子打构象不是很找啊。
赞一下(2人) 回复此楼
3楼2010-04-22 08:19:24
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

fooo

金虫 (正式写手)
★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
aylayl08(金币+2):谢谢讨论 2010-04-22 20:58
这样的分子体系，可能的构象已经非常非常多了，单纯用scan部分键长或键角恐怕难以找到所有的构象。最好先用分子力学、分子动力学等方法进行构象搜索，然后再用量子化学方法去计算。
引用回帖:
Originally posted by kekexiliwolf at 2010-04-22 08:45:54:

谢谢指教，那我试试吧，我的是一个20个C左右的有机分子

赞一下(2人) 回复此楼
5楼2010-04-22 11:00:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 9 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 0856材料与化工，270求调剂 +11 YXCT 2026-03-01 13/650 2026-03-02 21:38 by sunny81
[考研] 材料工程专硕283求调剂 5+5 ，！？ 2026-03-02 7/350 2026-03-02 20:27 by hypershenger
[考研] 环境调剂 +4 chenhanheng 2026-03-02 4/200 2026-03-02 20:23 by hypershenger
[考研] 272求调剂 +9 材紫有化 2026-02-28 9/450 2026-03-02 20:22 by hypershenger
[考研] 材料270求调剂 6+4 Eiiiio 2026-03-01 7/350 2026-03-02 20:17 by hypershenger
[考研] 材料类考研调剂 +3 gemmgemm 2026-03-01 4/200 2026-03-02 20:02 by hypershenger
[考研] 化学，材料，环境类求调剂 +7 考研版棒棒 2026-03-02 7/350 2026-03-02 19:56 by hypershenger
[考研] 302材料工程求调剂 +5 Doleres 2026-03-01 6/300 2026-03-02 19:53 by 张晓芳0105
[考研] 课题组接收材料类调剂研究生 +4 gaoxiaoniuma 2026-02-28 5/250 2026-03-02 19:33 by Xinyuu
[考博] 博士自荐 +4 kkluvs 2026-02-28 5/250 2026-03-02 19:19 by 轻松不少随
[考研] 求调剂 +10 yunziaaaaa 2026-03-01 11/550 2026-03-02 19:17 by caszguilin
[考研] 299求调剂 +4 kkcoco25 2026-03-02 4/200 2026-03-02 18:04 by barlinike
[考研] 欢迎采矿、地质、岩土、计算机、人工智能等专业的同学报考 +6 pin8023 2026-02-28 8/400 2026-03-02 17:13 by 0854蹲调剂
[考研] 化工专硕348，一志愿985求调剂 +6 弗格个 2026-02-28 9/450 2026-03-02 14:09 by liyongv
[基金申请] 面上模板改不了页边距吧？ +6 ieewxg 2026-02-25 7/350 2026-03-02 12:44 by stidwellNK
[考研] 材料学硕318求调剂 +14 February_Feb 2026-03-01 16/800 2026-03-02 11:17 by yuchj
[考研] 0854复试调剂 276 +4 wmm9 2026-03-01 6/300 2026-03-02 09:28 by 热情沙漠
[基金申请] 本子写完了，给DS兄弟看了，得了92分 +3 Doma 2026-03-01 7/350 2026-03-02 00:00 by jnzsy
[考研] 295复试调剂 +3 简木ChuFront 2026-03-01 3/150 2026-03-01 14:27 by zzxw520th
[硕博家园] 【博士招生】太原理工大学2026化工博士 +4 N1ce_try 2026-02-24 8/400 2026-02-26 08:40 by N1ce_try
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭