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绿茶QJM

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[交流] 【求助】如何让DS里画的格式，转化到SYBYL 已有10人参与

在DS里进行了分子对接，准备转到SYBYL里做COMFA

      直接用DS里的SYBYL MOL格式，转到SYBYL里无法显示

      然后，通过OPENBABEL进行转化，也无济于事

               哪位高人能指点下呢？

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1楼 2010-04-15 09:54:00

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引用回帖:

Originally posted by blue_cat at 2010-04-15 12:01:54:
DS画分子式挺麻烦的，你可以用isisdraw画或者chemdraw画好然后再导入到sybyl中不是更方便。

我在DS里不是为了画分子，而是为了用它的对接结果，得到的叠合构象，然后在SYBYL里做COMFA

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3楼2010-04-15 14:48:25

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[quote]Originally posted by arthurii at 2010-04-15 15:20:02:
一个个结构存为mol2或者pdb文件，兼容的，在sybyl里面直接打开可以的

存sd和sdf好像也可以，这个试过打开，没有提示错误，但没去看那个结果，只是好玩试了一试

以上，供参考

[ Last edited by arthurii ... [/quote

可以直接打开么，我打开了，屏幕里没有分子结构类

发现有好些分子结构形式，ent,pdb,类型,都没有结构显示

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5楼2010-04-15 16:28:22

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