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【求助】如何让DS里画的格式,转化到SYBYL
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绿茶QJM
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[交流]
【求助】如何让DS里画的格式,转化到SYBYL
已有10人参与
在DS里进行了分子对接,准备转到SYBYL里做COMFA
直接用DS里的SYBYL MOL格式,转到SYBYL里无法显示
然后,通过OPENBABEL进行转化,也无济于事
哪位高人能指点下呢?
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1楼
2010-04-15 09:54:00
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[quote]Originally posted by
arthurii
at 2010-04-15 15:20:02:
一个个结构存为mol2或者pdb文件,兼容的,在sybyl里面直接打开可以的
存sd和sdf好像也可以,这个试过打开,没有提示错误,但没去看那个结果,只是好玩试了一试
以上,供参考
[
Last edited by arthurii ... [/quote
可以直接打开么,我打开了,屏幕里没有分子结构类
发现有好些分子结构形式,ent,pdb,类型,都没有结构显示
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5楼
2010-04-15 16:28:22
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★
ghcacj(金币+1):谢谢 2010-04-15 12:10
绿茶QJM(金币+1): 2010-04-19 11:52
DS画分子式挺麻烦的,你可以用isisdraw画或者chemdraw画好然后再导入到sybyl中不是更方便。
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DS
2楼
2010-04-15 12:01:54
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引用回帖:
Originally posted by
blue_cat
at 2010-04-15 12:01:54:
DS画分子式挺麻烦的,你可以用isisdraw画或者chemdraw画好然后再导入到sybyl中不是更方便。
我在DS里不是为了画分子,而是为了用它的对接结果,得到的叠合构象,然后在SYBYL里做COMFA
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3楼
2010-04-15 14:48:25
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★ ★
ghcacj(金币+2):谢谢 2010-04-15 15:33
绿茶QJM(金币+1): 2010-04-15 16:12
一个个结构存为mol2或者pdb文件,兼容的,在sybyl里面直接打开可以的
存sd和sdf好像也可以,这个试过打开,没有提示错误,但没去看那个结果,只是好玩试了一试
以上,供参考
[
Last edited by arthurii on 2010-4-15 at 15:22
]
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4楼
2010-04-15 15:20:02
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