应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Gromacs/Amber/NAMD » 【求助】NAMD安装问题
201/2返回列表12下一页
查看: 2927  |  回复: 19
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

一步一步

木虫 (著名写手)

[交流] 【求助】NAMD安装问题 已有11人参与

在NAMD官方网站下载的NAMD安装程序，解压缩后双击执行文件出现对话框说namd.exe遇到问题需要关闭。在DOS对话框中出现这样的提示：

我想知道这个那个Fatal Error是什么导致的？？
我还下了个Source Code不知道那个是干什么用的。
希望高手帮忙解决一下，非常感谢！！
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2010-04-10 20:53:01
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

bay__gulf

金虫 (著名写手)

刘苏州
★ ★
ghcacj(金币+2):谢谢 2010-04-11 13:04
一步一步(金币+6): 2010-04-12 08:32
那个链接不算太好,参考这个
http://www.mdbbs.org/thread-22766-1-1.html
http://www.mdbbs.org/thread-22825-1-1.html
赞一下(2人) 回复此楼
4楼2010-04-11 11:52:03
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zyy816

至尊木虫 (著名写手)
★
一步一步(金币+3): 2010-04-12 08:32
ghcacj(金币+1):谢谢 2010-04-12 08:33
把config文件，就是体系的参数文件放上去，可能就OK了，比如：
namd2 1.conf
如果没有后面文件，绝对会出上面的错误。
赞一下(2人) 回复此楼
5楼2010-04-12 08:27:25
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

bay__gulf

金虫 (著名写手)

刘苏州
★
lei0736(金币+1):谢谢 2010-04-12 10:03
一步一步(金币+8): 2010-04-12 16:27
conf 文件是具体计算的任务文件,我在上面的三个帖子中给出过一个例子
赞一下(2人) 回复此楼
7楼2010-04-12 08:47:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

一步一步

木虫 (著名写手)
★
lei0736(金币+1):谢谢 2010-06-03 18:02:31
引用回帖:
Originally posted by baoer3808 at 2010-06-02 11:23:58:
我也遇到了同样的问题，现在是运行namd2 ubq_ws_eq.conf后可以读取模拟参数
可到后来说是不能打开chamm parameter file../common/par_all27_prot_lipid.inp
是charm++ fatal error 的问题，这个怎么解决啊？

你到你的那个common的文件夹下检查一下你的那个力场参数文件有没有，或者命名是不是错误的，另外就是仔细检查一下输入的命令对不对，我总觉得很可能是最后那种情况。我之前是那样的。。。

[ Last edited by 一步一步 on 2010-6-4 at 08:40 ]
赞一下(2人) 回复此楼
10楼2010-06-03 17:54:02
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通回帖

bay__gulf

金虫 (著名写手)

刘苏州
★ ★
lei0736(金币+2):谢谢 2010-04-11 11:06
一步一步(金币+3): 2010-04-11 11:16
参考 http://www.mdbbs.org/thread-19049-1-1.html
赞一下(1人) 回复此楼
2楼2010-04-10 21:17:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

一步一步

木虫 (著名写手)
引用回帖:
Originally posted by bay__gulf at 2010-04-10 21:17:34:
参考 http://www.mdbbs.org/thread-19049-1-1.html

没有解决啊
不过还是谢谢！！
赞一下 回复此楼
3楼2010-04-11 11:16:24
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

一步一步

木虫 (著名写手)
引用回帖:
Originally posted by zyy816 at 2010-04-12 08:27:25:
把config文件，就是体系的参数文件放上去，可能就OK了，比如：
namd2 1.conf
如果没有后面文件，绝对会出上面的错误。

这个config文件在哪里啊？？大家都说要找到这种**conf文件，但是我解压缩后没看到这个文件啊？？对了，在我下载的那个Source Code中有个config文件，是不是它啊？？刚接触这种Dos下运行的软件，所以一头雾水啊！！

[ Last edited by 一步一步 on 2010-4-12 at 08:36 ]
赞一下 回复此楼
6楼2010-04-12 08:31:45
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

一步一步

木虫 (著名写手)
引用回帖:
Originally posted by bay__gulf at 2010-04-12 08:47:42:
conf 文件是具体计算的任务文件,我在上面的三个帖子中给出过一个例子

老是得到bay_gulf的帮助，作为菜鸟的我真丢人啊！！
那个例子已经下载了，可以在NAMD中运行da.conf文件。
那就说明是能用的。
刚接触这种在Dos下运行的软件，所以很多问题不懂。
继续努力！！
再次谢谢你的帮助，非常的感激！
赞一下 回复此楼
8楼2010-04-12 16:27:03
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

baoer3808

银虫 (小有名气)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
我也遇到了同样的问题，现在是运行namd2 ubq_ws_eq.conf后可以读取模拟参数
可到后来说是不能打开chamm parameter file../common/par_all27_prot_lipid.inp
是charm++ fatal error 的问题，这个怎么解决啊？
赞一下(1人) 回复此楼
9楼2010-06-02 11:23:58
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 一步一步 的主题更新
201/2返回列表12下一页
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[有机交流] OpenAI又攻克数学难题了，离AI做有机合成还有多远？ +4 wangyl_123 2026-10-10 8/400 2026-10-12 18:09 by wangyl_123
[硕博家园] 极限拉扯，如何抉择 +5 Isak0320 2026-10-12 7/350 2026-10-12 18:03 by 有人要害朕
[教师之家] 课题组会帮你通过考核么？ +3 好运来～9527 2026-10-10 6/300 2026-10-12 14:55 by 简单化xn
[公派出国] 售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 10/500 2026-10-11 22:26 by XQNyDCa1Tk5n
[找工作] 售SCI一区T0P文章，我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 8/400 2026-10-11 22:26 by XQNyDCa1Tk5n
[考博] 售SCI一区T0P文章，我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 9/450 2026-10-11 22:15 by XQNyDCa1Tk5n
[考博] 售SCI一区文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 7/350 2026-10-11 22:11 by XQNyDCa1Tk5n
[教师之家] 售SCI文章，我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 (EPI+-1)(金币-50) +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 10/500 2026-10-11 22:06 by XQNyDCa1Tk5n
[基金申请] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 9/450 2026-10-11 22:06 by XQNyDCa1Tk5n
[教师之家] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 (EPI+-1)(金币-50) +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 10/500 2026-10-11 14:25 by VOMexwnDzOFZ
[教师之家] 售SCI文章，我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 (EPI+-1)(金币-50) +4 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 7/350 2026-10-11 14:05 by VOMexwnDzOFZ
[考研] 售SCI文章，我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 8/400 2026-10-11 13:51 by VOMexwnDzOFZ
[硕博家园] 售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 8/400 2026-10-11 13:45 by VOMexwnDzOFZ
[找工作] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 7/350 2026-10-11 10:54 by VOMexwnDzOFZ
[找工作] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +4 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 7/350 2026-10-11 10:34 by VOMexwnDzOFZ
[考博] 招收博士生一名 +3 mandolin 2026-10-10 3/150 2026-10-11 10:21 by 不是山谷！
[公派出国] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +4 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 4/200 2026-10-11 03:14 by M0zrYVSAnxpE
[有机交流] 各位大佬，路线设计求助 +6 zapen 2026-10-08 8/400 2026-10-10 15:59 by zapen
[基金申请] 入职后第一次管课题组的专利缴费，对账才发现官费比别人多掏了一倍 +5 13108017953 2026-10-08 5/250 2026-10-10 11:15 by wdwd123
[有机交流] 我应该选哪条合成路线让实验成功率高一些？ +5 jing816y 2026-10-08 9/450 2026-10-10 09:05 by zapen
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭