24小时热门版块排行榜    

查看: 2507  |  回复: 8
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

mophyworld

金虫 (正式写手)

[交流] 【求助】请教能量最小化问题 模拟退火与几何优化 已有1人参与

大家好,我建了一个含7000多个原子的体系进行分子动力学。在模拟之初,需要对其进行结构优化。大体上来说是,先进行Geometry optimization(GO),然后在进行MD平衡。但是在进行GO的时候,一直都收敛不了,该怎么办呢?看了一些文献,别人在进行GO的时候只是说明进行了多少步的GO,而不说多少步GO后能量最小化是否已经达到收敛,不过在这个Go后面,它们一般都会进行Annealing simulated(AS模拟退火),是否这样的结构优化结果会更接近于全局能量最小化点呢?GO与GO+AS进行结构优化之间的区别在哪儿?哪个方法更好些呢?
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

Ineedsomeinspirationandsomeconfidence
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xk6891

至尊木虫 (著名写手)

★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by qasd at 2009-11-25 10:10:53:
经典动力学的话没有必要收敛,达到能够进行动力学计算的程度就可以了

求教一下,版主的意思是不是收敛不收敛和MD 后面的平衡计算关系不大啊,但是我看cpmd说明书上,都是先介绍wavefunction optimization 或者geometry optimization,貌似是很大的,能不能详解一下这其中的道理。谢谢了
人生自古多险阻,勤者自得天酬助。试问否泰何所依,枯藤老枝待新抽。临渊踌躇终迈步,振翅鹏起云霄冲。似是前程甚堪忧,他日振臂揽苍穹。
9楼2010-09-03 15:28:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 9 个回答

gavinliu7390

木虫 (著名写手)

叶落鹰飞

★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
yjmaxpayne(金币+3,VIP+0):谢谢 11-25 21:08
我不知道你是不是建的超晶胞。
如果你要是直接优化7000个原子,我估计是很难收敛的。
因为模拟退火是找到全局最小,而几何优化是找局域极小值。
一般,模拟退火需要一个合理的初始结构,所以需要几何优化一下。而最终的目的是为了找全局最小值,实际是想找到新的结构,需要GO+AS。
真理是一点点接近的!
2楼2009-11-25 09:12:27
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

qasd

木虫 (著名写手)

★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
yjmaxpayne(金币+2,VIP+0):谢谢 11-25 21:08
经典动力学的话没有必要收敛,达到能够进行动力学计算的程度就可以了
3楼2009-11-25 10:10:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

mophyworld

金虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by qasd at 2009-11-25 10:10:
经典动力学的话没有必要收敛,达到能够进行动力学计算的程度就可以了

您好,那么请问怎么看才能知道是不是达到进行动力学计算的程度了呢?
Ineedsomeinspirationandsomeconfidence
4楼2009-11-30 08:56:23
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[论文投稿] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +3 cqwQDCxMcL3I 2026-09-29 4/200 2026-09-30 16:45 by Z9YWQ5EAO3qp
[找工作] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +3 cqwQDCxMcL3I 2026-09-29 4/200 2026-09-30 16:33 by Z9YWQ5EAO3qp
[公派出国] 售SCI一区文章,我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +3 cqwQDCxMcL3I 2026-09-29 6/300 2026-09-30 16:26 by Z9YWQ5EAO3qp
[考研] 售SCI一区文章,我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +3 cqwQDCxMcL3I 2026-09-29 6/300 2026-09-30 16:14 by Z9YWQ5EAO3qp
[公派出国] 售一区SCI文章T0P,我:8O.551.O54,科目全,可十急 +3 cqwQDCxMcL3I 2026-09-29 4/200 2026-09-30 13:35 by C3vABopYbZJS
[有机交流] 同一个分子,一条来自文献,一条来自AI——不告诉你答案,你会选哪条? +4 tianxiaoxian 2026-09-28 7/350 2026-09-30 08:34 by 88817753
[博后之家] 售SCI文章,我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +4 IDs3scOF0tjC 2026-09-28 4/200 2026-09-29 19:27 by cqwQDCxMcL3I
[找工作] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +4 ZYXdhzDAy9ZX 2026-09-28 4/200 2026-09-29 16:54 by yCO1Ll7aHtsw
[博后之家] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 ZYXdhzDAy9ZX 2026-09-28 3/150 2026-09-29 16:30 by etmYJ6d2rquH
[考博] 售一区SCI文章T0P,我:8O.551.O54,科目全,可十急 +3 tqUTOxClQUMF 2026-09-28 3/150 2026-09-29 15:46 by etmYJ6d2rquH
[公派出国] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +3 tqUTOxClQUMF 2026-09-28 3/150 2026-09-29 14:58 by etmYJ6d2rquH
[考博] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +6 GDBe8tDZqE8z 2026-09-28 6/300 2026-09-29 14:41 by etmYJ6d2rquH
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 GDBe8tDZqE8z 2026-09-28 3/150 2026-09-29 14:30 by etmYJ6d2rquH
[博后之家] 售SCI一区文章,我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +3 IDs3scOF0tjC 2026-09-28 3/150 2026-09-29 13:56 by etmYJ6d2rquH
[公派出国] 售一区SCI文章T0P,我:8O.551.O54,科目全,可十急 +4 IDs3scOF0tjC 2026-09-28 5/250 2026-09-29 13:50 by etmYJ6d2rquH
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 CfXuS1rDhLYN 2026-09-28 4/200 2026-09-28 22:55 by ez6fGg9abYaj
[公派出国] 售SCI一区文章,我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +4 IDs3scOF0tjC 2026-09-28 4/200 2026-09-28 22:55 by ez6fGg9abYaj
[考博] 售SCI文章,我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +3 IDs3scOF0tjC 2026-09-28 6/300 2026-09-28 22:15 by ez6fGg9abYaj
[论文投稿] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 CfXuS1rDhLYN 2026-09-28 3/150 2026-09-28 19:08 by 9lS3ad5oOymn
[考研] 售一区SCI文章T0P,我:8O.551.O54,科目全,可十急 +3 IDs3scOF0tjC 2026-09-28 4/200 2026-09-28 18:51 by 9lS3ad5oOymn
信息提示
请填处理意见