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cenwanglai

荣誉版主 (知名作家)

[交流] 【求助完毕】DFT结构优化和MC的均方根位移

一直留意凝聚态表面吸附小分子用MC/MD来跑的可行性。

有些问题一直没有理解到。请教：

经验力场分子模拟的初始结构建好后，需要能量（势能）最小化，得到平衡态结构后再做MC/MD?

MD得到体系轨迹，可以跟踪原子位移，如果已经优化到绝对零度下的全局能量最低态(DFT)，升高温度后MD的均方根位移是升温导致的扩散？对MD特定原子的坐标做时间平均，对于稳定结构，均方根位移是否应该为0？

MD的开始若干步均方根位移一直上升，指导接近于稳定。这是否说明MD也可以用来做结构优化？开始若干步均方根位移随时间增大，这是否可以对应DFT的结构优化过程？

[ Last edited by cenwanglai on 2011-4-28 at 10:34 ]
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1楼 2011-04-13 13:32:44
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