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cenwanglai

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[交流] 【求助完毕】DFT结构优化和MC的均方根位移

一直留意凝聚态表面吸附小分子用MC/MD来跑的可行性。

有些问题一直没有理解到。请教:

经验力场分子模拟的初始结构建好后,需要能量(势能)最小化,得到平衡态结构后再做MC/MD?

MD得到体系轨迹,可以跟踪原子位移,如果已经优化到绝对零度下的全局能量最低态(DFT),升高温度后MD的均方根位移是升温导致的扩散?对MD特定原子的坐标做时间平均,对于稳定结构,均方根位移是否应该为0?

MD的开始若干步均方根位移一直上升,指导接近于稳定。这是否说明MD也可以用来做结构优化?开始若干步均方根位移随时间增大,这是否可以对应DFT的结构优化过程?

[ Last edited by cenwanglai on 2011-4-28 at 10:34 ]
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