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【求助完毕】DFT结构优化和MC的均方根位移
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一直留意凝聚态表面吸附小分子用MC/MD来跑的可行性。 有些问题一直没有理解到。请教： 经验力场分子模拟的初始结构建好后，需要能量（势能）最小化，得到平衡态结构后再做MC/MD? MD得到体系轨迹，可以跟踪原子位移，如果已经优化到绝对零度下的全局能量最低态(DFT)，升高温度后MD的均方根位移是升温导致的扩散？对MD特定原子的坐标做时间平均，对于稳定结构，均方根位移是否应该为0？ MD的开始若干步均方根位移一直上升，指导接近于稳定。这是否说明MD也可以用来做结构优化？开始若干步均方根位移随时间增大，这是否可以对应DFT的结构优化过程？ [ Last edited by cenwanglai on 2011-4-28 at 10:34 ] |
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