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mophyworld

金虫 (正式写手)

[交流] 【求助】请教能量最小化问题 模拟退火与几何优化 已有1人参与

大家好,我建了一个含7000多个原子的体系进行分子动力学。在模拟之初,需要对其进行结构优化。大体上来说是,先进行Geometry optimization(GO),然后在进行MD平衡。但是在进行GO的时候,一直都收敛不了,该怎么办呢?看了一些文献,别人在进行GO的时候只是说明进行了多少步的GO,而不说多少步GO后能量最小化是否已经达到收敛,不过在这个Go后面,它们一般都会进行Annealing simulated(AS模拟退火),是否这样的结构优化结果会更接近于全局能量最小化点呢?GO与GO+AS进行结构优化之间的区别在哪儿?哪个方法更好些呢?
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mophyworld

金虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by qasd at 2009-11-25 10:10:
经典动力学的话没有必要收敛,达到能够进行动力学计算的程度就可以了

您好,那么请问怎么看才能知道是不是达到进行动力学计算的程度了呢?
Ineedsomeinspirationandsomeconfidence
4楼2009-11-30 08:56:23
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gavinliu7390

木虫 (著名写手)

叶落鹰飞

★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
yjmaxpayne(金币+3,VIP+0):谢谢 11-25 21:08
我不知道你是不是建的超晶胞。
如果你要是直接优化7000个原子,我估计是很难收敛的。
因为模拟退火是找到全局最小,而几何优化是找局域极小值。
一般,模拟退火需要一个合理的初始结构,所以需要几何优化一下。而最终的目的是为了找全局最小值,实际是想找到新的结构,需要GO+AS。
真理是一点点接近的!
2楼2009-11-25 09:12:27
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qasd

木虫 (著名写手)

★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
yjmaxpayne(金币+2,VIP+0):谢谢 11-25 21:08
经典动力学的话没有必要收敛,达到能够进行动力学计算的程度就可以了
3楼2009-11-25 10:10:53
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点点儿

金虫 (小有名气)

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
qasd(金币+1,VIP+0):基本正确~ 11-30 20:25
我觉得qasd版主的意思是,跑跑动力学试试,不自动停止就是行啊
5楼2009-11-30 10:12:51
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