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求助大片段载体构建
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我最近在将一个4700bp的基因连进T载体中,可是一直没有成功,现在已经做了3次了。大家有没有什么好的方法可以改进连接效率? 我的步骤如下: 基因4700bp,用primer star扩增之后,切胶回收目的条带,回收效率还行(取回收产物1ul做模板pcr能扩增出目的条带来),之后加A(8ul底物,30min),连进T载体(promega的),一般4度连接过夜,转化,蓝白斑筛选。第二天板子上能看见白斑,但是挑斑,pcr验证却总是假阳性,提质粒验证,分子量是2500bp左右,肯定是T载体自连了。但是那些白斑是什么啊? 现在做了3次都是这样,就是连不进去。快郁闷死了,大家有什么好的建议?多谢了!!! |
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4.7k的不算大,连应该没问题的。 你的a尾加的有问题吗,一般的酶都可以吧,都是pcr的时候加上的。 酶连4-16°都可以的,这个没问题。8h以上都可以。 关于白斑的这个,大家都遇到过,理论上自联应该是蓝斑,但是好多时候是白的。个人认为其可能连上了一些很小的片段,<100bp。你可以随机拿几个去测序看看,验证自己的想法。看看到底是空的还是连上了什么东西。 至于重复的,你做的时候可以多做几个,t量不变,片段有差别,做几个,总有一个可以的。 祝实验成功! |

2楼2009-10-08 15:32:11
amisking
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amisking(金币+3,VIP+0): 10-11 08:18
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实验有时候就是要试试才知道的。 偶觉得你加的a尾存在问题,是不是没加上? primer star 是不加A尾的酶吗?你用LA扩也一样啊,即保证保真性,又加了a尾,5kb的片段是有点长了,不过你要是想做后续实验,最终要测序验证的。 如果条带亮度和marker差不多的,我一般做4个: 10ul: 产物:T-------1:1, 1:2, 2:1, 2:2, 酶0.5,buf1,其他补水 最后混在一起,转化两管,基本没大问题 lz是在没辙了,不妨试试此拙见。 |

10楼2009-10-08 23:18:42













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