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qphll金虫 (正式写手)
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[交流]
【求助】关于结构参数的优化
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一直有个问题不是很清楚,请有经验的大家解答一下. 在做结构参数优化的时候,如果需要优化的参数不止一个,那么应该怎样? 比如,如果需要对Orthorhombic(正交)盒子进行优化, 那么就会涉及到需要优化的参数有三个. 如果是在pwscf中,那么就是a, b/a和c/a. 对于我而已,我是想研究小分子在表面的分解, 那么一般c取到一定大以后,就不去考虑c/a的优化了. 那么在实际的操作中怎么分别优化a和b/a? 我的理解和做法是这样的: 分两步来 (1) 固定b/a的值,看a变化的过程中,体系总能量的变化,从而找到a的优化值; (2) 固定a值为(1)中找到的最优值,然后调节b/a的值, (事实上这里就是等同于改变b的值), 然后找到b的最优值. 请大家评价一下,是不是就是这样做的? 还有,如果我是这样两步做的: (1) 固定b的值,看a变化的过程中,体系总能量的变化,从而找到a的优化值; (2) 固定a值为(1)中找到的最优值,然后改变b的值, 然后找到b的最优值. 如果这样做,那么和前面的那种优化方法有啥本质的区别吗? 搬个板凳,带着笔记,等大家拍砖. |
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2楼2009-09-23 09:32:08
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3楼2009-09-23 09:37:32
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4楼2009-09-23 10:52:22
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PWscf的参数“cell_dofree”专门处理你提出的问题，只优化a,b而固定c 但是这个方法bfgs好像是暂时还没有实现，你需使用共轭梯度法 你可以看看这个：“http://blog.sina.com.cn/s/blog_5f15ead20100e1lu.html###”（Some fundamental concept and parameters of pwscf） 里面有关于此问题PWscf forum的网址 |
5楼2009-09-24 09:47:17
qphll
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多谢楼上三位的参与. 对于我自己的特定体系而已, 我发帖的里面提到的结构参数的优化问题已经想明白了. 对于graphene而言,因为我自己编程生成graphene的原因,我的盒子是Orthorhombic的,a,b,c三个值各不相等,alpha, beta, gamma 都是90度. 如果想想结构优化的目的,我想对于我的体系而已,无非是因为在生成graphene的时候, C-C的键长使用了实验值1.42 那么这里结构优化的目的,就是通过盒子的'扩张'或者'收缩', 找到一个合适的C-C键长而已. 如果keep that in mind, 那么虽然我这里a和b的数值是不相等的,但是其实它们也不是互相独立的.如果我将a (X轴)拉伸,那么为了维持graphene中C-C键长的一致性, b(Y轴)必定得要按比例拉伸. 这里c (Z轴)在取到一定值以后,保证graphene面和它的Z轴镜像没有相互左右以后,就不需要优化啦. 所以我想,对于我的这个长方体的模拟盒子,放在pwscf里面考虑lattice parameter优化的话,是可以这么一步做的: (在in文件中,有celldm(1)=a, celldm(2)=b/a,celldm(3)=c/a 这三个参数) 固定b/a的值,固定c的值, 看a变化的过程中,体系总能量的变化,从而找到a的优化值 (事实上b/a固定的话,那么a的最优值找到了,那么b的值也相应找到了). 超级新手, pw里面的vc-relax没有尝试,看manual也似乎没说啥,例子也没有找到. y1ding可否提供一个in文件给我学习学习? |
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