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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » 【求助】关于复杂的结构参数的优化
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qiqi2926

铜虫 (小有名气)

[交流] 【求助】关于复杂的结构参数的优化已有3人参与

在侯柱峰老师的文章中看到有这么一句话（《VASP入门指南》-page25）：得到E-V曲线后，通过状态方程拟合得到平衡状态下的体积，计算出脚本中变量i的值。这个怎么计算啊？？？
并改变i的循环值，这个是什么意思，具体是怎么操作的？？？
再次运行run_cell计算一次，得到其他结构参数c和位置u。。。这个从哪里可以看出？或者怎样能够得到？？
（脚本为书中例子）：
#!/bin/sh
rm WAVECAR
for i in 2.81 2.91 3.01 3.11 3.21 3.31 3.41 3.51 3.61 3.71
do
cat > POSCAR < Mg-hex
$i
0.0 -1.0 0.0
0.8660254037844 0.5 0.0
0.0 0.0 1.6230529595
2
Direct
0.6666666666666667 0.3333333333333333 0.750
0.3333333333333333 0.6666666666666667 0.250
!
cp INCAR.relax INCAR
echo "a = $i angstrom " ; time vasp
cp CONTCAR POSCAR
cp INCAR.static INCAR
echo "a = $i angstrom " ; time vasp
E=‘grep "TOTEN" OUTCAR | tail -1 | awk ’{printf "%12.6f \n", $5 }’‘
V=‘grep "volume" OUTCAR | tail -1 | awk ’{printf "%12.4f \n", $5 }’‘
echo $V $E >>EtVo.dat
done

[ Last edited by qiqi2926 on 2010-6-26 at 14:02 ]
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1楼2010-06-26 10:46:31
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hedaors

禁虫 (正式写手)

隐清堂主
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
gavinliu7390(金币+1):谢谢交流！ 2010-06-26 15:22:21
你最好把脚本贴上来，不然别人不知你说的 i 是什么.

是 侯柱锋  老师，下次最好把名字写对，表示尊敬 :-)
赞一下(2人) 回复此楼
2楼2010-06-26 13:04:56
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qiqi2926

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by hedaors at 2010-06-26 13:04:56:
你最好把脚本贴上来，不然别人不知你说的 i 是什么.

是 侯柱锋  老师，下次最好把名字写对，表示尊敬 :-)

呵呵，打字的时候忘记检查了。。。谢谢
赞一下 回复此楼
3楼2010-06-26 14:03:48
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hedaors

禁虫 (正式写手)

隐清堂主
★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
gavinliu7390(金币+2):谢谢交流！ 2010-06-26 15:22:42
cenwanglai(金币+1):恩,费心了! 2010-06-26 19:33:51
for i in 2.81 2.91 3.01 3.11 3.21 3.31 3.41 3.51 3.61 3.71
这个语句是一个循环，每改变一个 i 值，做一个计算。

你没用过 Linux ? 你需要下功夫补补 Linux 的 Shell 脚本知识了，用 VASP 必须要会的。

这有个不错的教程:
http://tldp.org/LDP/abs/html/

也可一看看中文版
http://wenku.baidu.com/view/ab2cfe21dd36a32d73758196.html
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4楼2010-06-26 14:20:28
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lgxyz

铜虫 (正式写手)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
cenwanglai(金币+1):呵呵,直接用二次曲线拟合得到i就可以了. 2010-06-26 19:34:27
在小木虫上搜murn.f程序，用来拟合晶格常数，具体的用法就在侯老师那本书的后面。
拟合出来晶格常数的值（即i的值）后，在做一次结构弛豫即INCAR.relax便可得到其他结构参数的值了，具体怎么得到要依据晶胞的结构特征。不知我这样理解是否正确，还请高手指点，仅供楼主参考，共同学习！
赞一下(3人) 回复此楼
5楼2010-06-26 17:15:10
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qiqi2926

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by lgxyz at 2010-06-26 17:15:10:
在小木虫上搜murn.f程序，用来拟合晶格常数，具体的用法就在侯老师那本书的后面。
拟合出来晶格常数的值（即i的值）后，在做一次结构弛豫即INCAR.relax便可得到其他结构参数的值了，具体怎么得到要依据晶胞的结构 ...

拟合出晶格常数i，那么如何得到b和原子位置u。直接乘进去吗？？？
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6楼2010-06-28 09:33:59
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