| 查看: 3206 | 回复: 11 | |||
| 【悬赏金币】回答本帖问题，作者mahoumeimei将赠送您 20 个金币 | |||
mahoumeimei金虫 (小有名气)
|
[求助]
多条基因序列方向判断
|
||
|
请教一个小白问题。 我从NCBI上下载了一批基因序列，请问有什么方法可以迅速判断这些序列的方向性吗？以至于后面做OTU分析时，不会因为序列方向相反而出现错误的OTU分组结果。 |
回复此楼» 猜你喜欢
蛋白质检测：精准分析，解锁生物分子的密码
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验之小鼠实验：严谨设计，解析生命机制的重要载体
已经有0人回复
-
化学工程及工业化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有139人回复
-
不合理蛙科研实验之重金属检测：精准筛查，守护健康与环境的防线
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验之“蛙测重金属我背锅三千”
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验之“鼠逃三次我发三篇SCI”
已经有0人回复
-
纳米粒度分析
已经有3人回复
-
林科院林化所招收材料与化工专业硕士，坐标南京
已经有0人回复
-
留学--博士招生
已经有15人回复
-
化学工程，本211，求调剂，ab区不限
已经有4人回复
2楼2020-09-17 09:30:24
mahoumeimei
金虫 (小有名气)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 736.6
- 红花: 1
- 帖子: 205
- 在线: 124.5小时
- 虫号: 1258265
- 注册: 2011-04-07
- 性别: MM
- 专业: 环境微生物学
3楼2020-09-17 22:07:31
4楼2020-09-18 08:57:52
mahoumeimei
金虫 (小有名气)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 736.6
- 红花: 1
- 帖子: 205
- 在线: 124.5小时
- 虫号: 1258265
- 注册: 2011-04-07
- 性别: MM
- 专业: 环境微生物学
|
非常感谢你的回复！ 我现在的情况是，我下载了多条序列，需要通过软件比对找到这些序列之间的相同区域以及差异区域。但是如果我比对时这些序列是正负链混在一起的，那么软件只是客观地显示出这些序列的比对结果（我用的mega软件比对），并不会自动在比对过程中调整序列成为正链/负链。而我也不清楚这些序列中哪些是正链/负链，所以就无法正确获得相同/差异区域。 你建议的第一点，说将其与基因组进行比对获得信息，这对于我下载的多条序列来说，好像操作起来不是太合适呢（或者我没有理解你说的操作步骤？）。查询这个基因的基本信息，是哪个信息点会显示出正负链呢？我好像在序列页面没看到相关信息耶。 还望指教！多谢多谢多谢！ |
5楼2020-09-18 14:22:44
6楼2020-09-18 15:45:31
mahoumeimei
金虫 (小有名气)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 736.6
- 红花: 1
- 帖子: 205
- 在线: 124.5小时
- 虫号: 1258265
- 注册: 2011-04-07
- 性别: MM
- 专业: 环境微生物学
7楼2020-09-18 16:18:51
8楼2020-09-18 16:26:20
mahoumeimei
金虫 (小有名气)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 736.6
- 红花: 1
- 帖子: 205
- 在线: 124.5小时
- 虫号: 1258265
- 注册: 2011-04-07
- 性别: MM
- 专业: 环境微生物学
9楼2020-09-18 16:43:47
10楼2020-09-18 17:08:59
5