24小时热门版块排行榜    

北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
查看: 1136  |  回复: 8
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

zhang_yu1011

新虫 (初入文坛)

[求助] 分子对接前的配体优化问题 已有2人参与

配体分子的优化方法大家提供的都是用chem3D,但是我这有配体的晶体结构,也要用chem3D吗,还是可以用高斯优化?求助!非常感谢!
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

autodockytu

捐助贵宾 (小有名气)


【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
用chemi3d 处理一下,MM94优化及Minimum energy就可以
5楼2017-10-24 14:17:55
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 9 个回答

hclwonder

新虫 (正式写手)

大分子的晶体结构也是要prepare的,小分子的不清楚。用高斯优化应该可以,只是可能有点浪费,你用什么对接软件,没有小分子的prepare模块?

发自小木虫Android客户端
2楼2017-10-23 18:38:26
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhang_yu1011

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by hclwonder at 2017-10-23 18:38:26
大分子的晶体结构也是要prepare的,小分子的不清楚。用高斯优化应该可以,只是可能有点浪费,你用什么对接软件,没有小分子的prepare模块?

用的Autodock
3楼2017-10-23 21:33:04
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hclwonder

新虫 (正式写手)

autodock不熟。高斯优化是可以的,保存mol2格式,然后autodock用。

发自小木虫Android客户端

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

4楼2017-10-24 11:20:25
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 329求调剂 +5 星野? 2026-03-26 5/250 2026-03-28 08:17 by Iveryant
[考研] 266分,求材料冶金能源化工等调剂 +6 哇呼哼呼哼 2026-03-27 8/400 2026-03-28 07:15 by mmm just
[考研] 0703化学求调剂,各位老师看看我!!! +5 祁祺祺 2026-03-25 5/250 2026-03-27 21:44 by 东方猪猪
[有机交流] 高温高压反应求助 10+4 chibby 2026-03-25 4/200 2026-03-27 21:08 by BT20230424
[考研] 07化学280分求调剂 +10 722865 2026-03-23 10/500 2026-03-27 15:51 by Plutoqq
[考研] 307求调剂 +8 超级伊昂大王 2026-03-24 9/450 2026-03-27 15:34 by 超级伊昂大王
[考研] 一志愿北京化工大学材料与化工 264分各科过A区国家线 +10 哈哈157349 2026-03-21 10/500 2026-03-27 13:06 by zzll406
[考研] 071000生物学求调剂,初试成绩343 +6 小小甜面团 2026-03-25 6/300 2026-03-26 23:01 by 不吃魚的貓
[考研] 321求调剂 +5 材料cailiao 2026-03-21 5/250 2026-03-26 20:41 by fmesaito
[考研] 081700 调剂 267分 +11 迷人的哈哈 2026-03-23 11/550 2026-03-26 15:41 by zzll406
[考研] 求b区院校调剂 +4 周56 2026-03-24 5/250 2026-03-25 17:12 by yishunmin
[考研] 284求调剂 +15 Zhao anqi 2026-03-22 15/750 2026-03-25 12:51 by wht0531
[考研] 0854电子信息求调剂 324 +4 Promise-jyl 2026-03-23 4/200 2026-03-25 11:36 by Sugarlight
[考研] 318求调剂 +5 plum李子 2026-03-21 8/400 2026-03-25 09:26 by aa331100
[考研] 生物学学硕求调剂 +7 小羊睡着了? 2026-03-23 10/500 2026-03-25 02:24 by 清风拂扬。 m
[考研] 300分,材料,求调剂,英一数二 +5 超赞的 2026-03-24 5/250 2026-03-24 21:07 by 星空星月
[考研] 341求调剂(一志愿湖南大学070300) +5 番茄头--- 2026-03-22 6/300 2026-03-23 23:45 by Txy@872106
[考研] 材料/农业专业,07/08开头均可,过线就行 +3 呵唔哦豁 2026-03-23 4/200 2026-03-23 22:30 by 汪!?!
[考研] 接收2026硕士调剂(学硕+专硕) +4 allen-yin 2026-03-23 6/300 2026-03-23 15:04 by 汪!?!
[考研] 求调剂一志愿海大,0703化学学硕304分,有大创项目,四级已过 +6 幸运哩哩 2026-03-22 10/500 2026-03-22 20:10 by edmund7
信息提示
请填处理意见