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yafen0628

金虫 (正式写手)

[求助] PCR污染,存在假阳性带,,盼大神急救 已有3人参与

我在PCR过程中遇到很奇葩的现象,阴性对照组(模板为水),会P出来阳性条带,而且与目的带(目的带在186bp左右)大小在同一位置。
1,尝试了更换不同的退火温度(58/62/65),假阳性带依然存在。。。。,
2,曾经以为假阳性带会是交叉引物二聚体类产物,尝试了PCR体系中添加5%DMSO以及将引物100℃煮沸再用,结果还是存在假阳性。。
3,试着换掉了TAQ酶及DNTP还有水,依然是徒劳。。。

下图的左一模板为水,后面依次为不同浓度的阳性模板。。PCR的退火温度为58℃,循环数目35.

我想请教下各位大神,还有什么好的办法来找到PCR污染或者假阳性带的原因,或者是不是因为目的带偏小,所以才会遇到这种问题呢,尝试了各种办法,最近真是被愁死了,要P疯了。。。

PCR污染,存在假阳性带,,盼大神急救
20170516  HHV8 35 cycle.JPG
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971731043

新虫 (职业作家)

可以在超净台里试试,可能引物被污染了

发自小木虫Android客户端
5楼2017-06-23 09:04:09
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781055707

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
气溶胶污染,换引物,在做下去也不会太好的。
采菊东篱下,悠然见南山。
6楼2017-06-23 10:39:56
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as1688816

木虫 (正式写手)

估计是酶问题?你是不是用的mix扩的?可以换个牌子试试,或者不用mix

发自小木虫Android客户端
2楼2017-06-22 23:21:05
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yafen0628

金虫 (正式写手)

引用回帖:
6楼: Originally posted by 781055707 at 2017-06-23 10:39:56
气溶胶污染,换引物,在做下去也不会太好的。

重新开启了新合成的引物,结果是一样的。然后重新设计了其他的引物(目的片段均比较小,小于200),还是有这种现象出现。难道会是PCR的退火温度需要再摸索?

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7楼2017-06-23 13:04:52
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as1688816

木虫 (正式写手)


西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2017-06-23 23:23:05
引用回帖:
3楼: Originally posted by yafen0628 at 2017-06-23 06:48:17
不是mix ,酶是用的thermo的
...

哦,那就不知道原因了,我以前也遇到过这种问题,不过我用的是mix,当时换个mix就好了,也怀疑过水有问题,不过换了很多水还是有带,一般是很短的片段,如果扩的是很长的片段,一般不会有带的。

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4楼2017-06-23 08:30:53
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yafen0628

金虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by as1688816 at 2017-06-22 23:21:05
估计是酶问题?你是不是用的mix扩的?可以换个牌子试试,或者不用mix

不是mix ,酶是用的thermo的

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3楼2017-06-23 06:48:17
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yafen0628

金虫 (正式写手)

引用回帖:
5楼: Originally posted by 971731043 at 2017-06-23 09:04:09
可以在超净台里试试,可能引物被污染了

在超净台试过了,抢也换了其他的。。。然而,没有用。。。

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8楼2017-06-23 13:06:26
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971731043

新虫 (职业作家)

引用回帖:
8楼: Originally posted by yafen0628 at 2017-06-23 13:06:26
在超净台试过了,抢也换了其他的。。。然而,没有用。。。
...

可能你的引物母液就已经被污染了

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9楼2017-06-23 14:42:44
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781055707

木虫 (著名写手)

引用回帖:
7楼: Originally posted by yafen0628 at 2017-06-23 13:04:52
重新开启了新合成的引物,结果是一样的。然后重新设计了其他的引物(目的片段均比较小,小于200),还是有这种现象出现。难道会是PCR的退火温度需要再摸索?
...

换其他基因呀。
采菊东篱下,悠然见南山。
10楼2017-06-23 15:31:25
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