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Dmol3寻找过渡态
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以A+·OH→B反应为例,反应物结构是A+·OH,我发现如果A和·OH放置的相对位置不同,计算所得的反应热和能垒就存在很大差异,那么在计算中,到底怎么处理两者之间的相对位置才能得到可靠的结果。 还有就是在搜索过渡态过程中,使用RMS convergence=0.002(fine精度)总是计算失败,而将此值增大为0.005时则能很快计算成功,到底为什么会这样,如何能在fine精度下计算成功呢?需要怎么样调整反应物构型?希望大家给出宝贵意见,谢谢 |
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睡眼惺忪的人: 金币+50, ★★★★★最佳答案 2017-02-15 10:54:12
| 如果A和·OH之间不是弱作用到成键作用的转换的话,A+·OH很有可能是找不出过渡态的,至少过渡态两端连接的是稳定的反应物和产物。整个过程不是很复杂,你可以通过扫描势能面检验之(可以自己生成一套这样的xtd轨迹,仅做LST看看)。要小心的是,两个片段可能放的超出截断半径的距离,这种情况基函数根本没有重叠,有可能会得不到正确的结果。 |

2楼2017-02-14 19:43:27
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