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生物药学

新虫 (小有名气)

[交流] 菌液pcr

现在挑取单菌落,20ul体系,出现模糊的条带,引物二聚体很严重,请问大家怎么能p出条带,避免引物二聚体的出现?引物啊现在已经是0.5ul了

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976592787

木虫 (正式写手)

国家自然科学基金委员会委员长

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西门吹雪170: 金币+2, 鼓励回帖交流 2017-01-31 21:35:55
引物浓度多大的,是10uM的吗,该不会是100uM的吧?标准的使用应该是50ul体系用1ul,我们用菌液pcr只使用体系10ul,不知道你用的什么酶,taq还是pfu或者primerstar酶?是什么模板啊,待验证质粒的还是已验证的用来p片段做克隆的啊,你不说清楚怎么给你解决?

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耻与众草之为伍,何亭亭而独芳!何不为人之所赏兮,深山穷谷委严霜。
3楼2017-01-31 20:09:37
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普通回帖

贾子阳009

铜虫 (小有名气)


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你这是在实验室做实验吗?

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2楼2017-01-31 11:13:00
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裤头村的稻米

新虫 (小有名气)

★ ★
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西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2017-01-31 21:36:13
菌沾一下下就行,我做的是青枯,在选择培养基上培养出来的单菌落条带不是很亮,纯培养以后条带很亮,二聚体很少。

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4楼2017-01-31 20:43:05
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痞子无敌

金虫 (正式写手)


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引用回帖:
3楼: Originally posted by 976592787 at 2017-01-31 20:09:37
引物浓度多大的,是10uM的吗,该不会是100uM的吧?标准的使用应该是50ul体系用1ul,我们用菌液pcr只使用体系10ul,不知道你用的什么酶,taq还是pfu或者primerstar酶?是什么模板啊,待验证质粒的还是已验证的用来p片 ...

大神,酵母接触过吗?

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当你当你的眼睛眯着笑
5楼2017-02-01 08:42:34
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strmond

铁虫 (小有名气)


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第一,很可能是假阳性克隆;第二,调一下退火温度。第三,目的条带多大,是用何种酶PCR

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6楼2017-02-01 09:14:48
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生物药学

新虫 (小有名气)

目的条带500bp,用的green mix.做的宏基因组文库的筛选,

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7楼2017-02-01 11:49:40
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生物药学

新虫 (小有名气)

引用回帖:
6楼: Originally posted by strmond at 2017-02-01 09:14:48
第一,很可能是假阳性克隆;第二,调一下退火温度。第三,目的条带多大,是用何种酶PCR

退火调高还是调低?为什么会出现这么多二聚体呢?

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8楼2017-02-01 11:50:25
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生物药学

新虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 976592787 at 2017-01-31 20:09:37
引物浓度多大的,是10uM的吗,该不会是100uM的吧?标准的使用应该是50ul体系用1ul,我们用菌液pcr只使用体系10ul,不知道你用的什么酶,taq还是pfu或者primerstar酶?是什么模板啊,待验证质粒的还是已验证的用来p片 ...

我的引物浓度10um,用的green. mix酶,做宏基因组文库的筛选,用于p ks片段,最后测序用。但是之前菌夜pcr还是很好的,现在做菌落pcr为什么引物二聚体这么多么?今天老师说菌的数量有些多,是不是这么个道理,还说泡胶时间要长一些?

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9楼2017-02-01 11:55:30
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strmond

铁虫 (小有名气)


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引用回帖:
8楼: Originally posted by 生物药学 at 2017-02-01 11:50:25
退火调高还是调低?为什么会出现这么多二聚体呢?
...

退火温度低昜出现二聚体

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10楼2017-02-01 13:01:46
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