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2016123

新虫 (初入文坛)

[求助] 纯菌种提取DNA已有1人参与

小白求助。我师兄培养了两株纯菌,说让我提一下DNA,测一下16s。那这个提完之后,需要pcr或电泳之类的吗还是直接测序之类的。我新手不懂,师兄是做微生物培养的,也不懂分子生物。谢谢。(新手,没几个金币,望见谅)
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flhua

木虫 (正式写手)

bachelordom

27F 1492R 引物测序 ,在与NCBI数据库比对

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只要有梦想,坚持就一定能实现
2楼2016-12-27 11:18:38
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peitaokong

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2016-12-28 07:40:55
设计16S的全长引物,然后扩增全长,跑电泳,正确条带切胶测序,比对。
3楼2016-12-27 11:57:32
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2016123

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by peitaokong at 2016-12-27 11:57:32
设计16S的全长引物,然后扩增全长,跑电泳,正确条带切胶测序,比对。

这菌以前分离纯化时,已经测了16s 。然后养了大半年时间。师兄现在说再测测16s。这我就不明白了,怕污染?,半年也不会变异啊?所以我现在比较困惑。您认为这还有必要再测16s吗

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4楼2016-12-27 19:16:21
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2016123

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by flhua at 2016-12-27 11:18:38
27F 1492R 引物测序 ,在与NCBI数据库比对

以前就测过16s 做了菌种鉴定。养了段时间,师兄说再测一次,所以我很困惑。您怎么看?

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5楼2016-12-27 19:18:40
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peitaokong

银虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by 2016123 at 2016-12-27 19:16:21
这菌以前分离纯化时,已经测了16s 。然后养了大半年时间。师兄现在说再测测16s。这我就不明白了,怕污染?,半年也不会变异啊?所以我现在比较困惑。您认为这还有必要再测16s吗
...

我觉得有必要。这样做还是比较严谨的。菌种在传代过程中,容易退化而且是容易变异的。

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

6楼2016-12-27 20:02:24
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2016123

新虫 (初入文坛)

这样呢。就是说还得pcr,再跑胶测序。知道了,谢谢您。

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7楼2016-12-27 22:54:51
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2016123

新虫 (初入文坛)

送红花一朵
引用回帖:
6楼: Originally posted by peitaokong at 2016-12-27 20:02:24
我觉得有必要。这样做还是比较严谨的。菌种在传代过程中,容易退化而且是容易变异的。...

这样呢。就是说还得PCR,跑胶再测序。知道了,谢谢您

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8楼2016-12-27 22:56:52
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DHX555888

新虫 (初入文坛)

您好 想问下你菌种提取DNA的方法
不忘初心
9楼2020-09-07 08:52:43
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