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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 核酸提取 » 纯菌种提取DNA
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2016123

新虫 (初入文坛)

[求助] 纯菌种提取DNA 已有1人参与

小白求助。我师兄培养了两株纯菌，说让我提一下DNA,测一下16s。那这个提完之后，需要pcr或电泳之类的吗还是直接测序之类的。我新手不懂，师兄是做微生物培养的，也不懂分子生物。谢谢。(新手，没几个金币，望见谅）
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1楼 2016-12-27 11:15:31
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flhua

木虫 (正式写手)

bachelordom
27F 1492R 引物测序 ，在与NCBI数据库比对

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只要有梦想，坚持就一定能实现
2楼2016-12-27 11:18:38
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peitaokong

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2016-12-28 07:40:55
设计16S的全长引物，然后扩增全长，跑电泳，正确条带切胶测序,比对。
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3楼2016-12-27 11:57:32
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2016123

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
3楼: Originally posted by peitaokong at 2016-12-27 11:57:32
设计16S的全长引物，然后扩增全长，跑电泳，正确条带切胶测序,比对。

这菌以前分离纯化时，已经测了16s 。然后养了大半年时间。师兄现在说再测测16s。这我就不明白了，怕污染?，半年也不会变异啊?所以我现在比较困惑。您认为这还有必要再测16s吗

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4楼2016-12-27 19:16:21
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2016123

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by flhua at 2016-12-27 11:18:38
27F 1492R 引物测序 ，在与NCBI数据库比对

以前就测过16s 做了菌种鉴定。养了段时间，师兄说再测一次，所以我很困惑。您怎么看?

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5楼2016-12-27 19:18:40
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peitaokong

银虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by 2016123 at 2016-12-27 19:16:21
这菌以前分离纯化时，已经测了16s 。然后养了大半年时间。师兄现在说再测测16s。这我就不明白了，怕污染?，半年也不会变异啊?所以我现在比较困惑。您认为这还有必要再测16s吗
...

我觉得有必要。这样做还是比较严谨的。菌种在传代过程中，容易退化而且是容易变异的。
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2016123
6楼2016-12-27 20:02:24
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2016123

新虫 (初入文坛)
这样呢。就是说还得pcr，再跑胶测序。知道了，谢谢您。

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7楼2016-12-27 22:54:51
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2016123

新虫 (初入文坛)
送红花一朵
引用回帖:
6楼: Originally posted by peitaokong at 2016-12-27 20:02:24
我觉得有必要。这样做还是比较严谨的。菌种在传代过程中，容易退化而且是容易变异的。...

这样呢。就是说还得PCR,跑胶再测序。知道了，谢谢您

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8楼2016-12-27 22:56:52
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DHX555888

新虫 (初入文坛)
您好 想问下你菌种提取DNA的方法
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不忘初心
9楼2020-09-07 08:52:43
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