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SSR条带不清晰 已有1人参与
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跑的是变性的聚丙烯酰胺的凝胶，最近总出现条带模糊的情况，实在找不到原因，寻求各位大神的帮助   @biostar2009 @飞约疯人院 @wizardfan @youlinglyw 发自小木虫Android客户端 |
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yujiaping1
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从第一张图看，越两边的样品条带清楚，中间的模糊，这显然是电泳的问题。做微卫星我2007年前后，做了四年，我可以负责任的告诉你，你的引物没有问题，PCR可以提高一下退火温度，当然如果知道什么是touch down PCR，用touch down解决会更好。但是PCR优化只是解决上面那些杂带，让你的条带只有目的带，和主题要解决的电泳模糊问题不相干。电泳的问题挺复杂的，我更怀疑点样孔挂胶的问题，但是不知道你的点样孔是不是和以前一样干净。如果不是电泳空的问题，建议换个电泳槽，看起来溶液不像有问题 发自小木虫IOS客户端 |
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凯瑟11楼2016-12-25 21:45:37
yujiaping1
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你这是什么电泳系统，薄厚多少，怎么会50V跑一夜，我们都是160V，180V跑两三个小时，胶厚度1mm，长度大概180*120。你如果只能过夜，效率太低了，我们一次两张版，加染色一天可以跑六张版，引物优化好的大小差距大，可以同一个板跑两个 关于你之前的问题看来不是挂胶的问题，肯定是电泳系统的问题，换了电泳槽，还不好再说吧 发自小木虫IOS客户端 |
18楼2017-01-02 20:05:41