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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 分类/鉴定 » 关于系统发育树
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可度77

新虫 (小有名气)

[求助] 关于系统发育树 已有1人参与

这是我做的一个系统发育树，红色的两个框里的应该是同一个属的，为什么离得这么远没有聚到一类里反而蓝色框里的跟他们不同类的离得更近呢？？？

关于系统发育树
91.png


关于系统发育树-1
求助.png
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1楼 2016-12-13 10:55:22
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回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

gastrodia

金虫 (正式写手)
做系统发育，最好加外类群

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可度77
17楼2016-12-14 16:25:50
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Probiotics

木虫 (正式写手)
做系统发育树，需要用模式菌株的相应基因序列，用别的菌株是不对的。

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5楼2016-12-13 14:28:51
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Probiotics

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
引用回帖:
6楼: Originally posted by 可度77 at 2016-12-13 16:02:23
序列都是从blast中找的发表过得菌株
...

这样不行，只有模式株才行，这才是唯一标准。万一别人发表的有错的呢，对吧。

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7楼2016-12-13 16:05:35
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苦笑着我自

新虫 (正式写手)
楼主用什么软件做的啊？
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2楼2016-12-13 11:11:48
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可度77

新虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 苦笑着我自 at 2016-12-13 11:11:48
楼主用什么软件做的啊？

mega

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3楼2016-12-13 13:50:23
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边缘未央

新虫 (小有名气)
可能种间相似程度大 可以多找几个种试试

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4楼2016-12-13 14:17:31
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可度77

新虫 (小有名气)
引用回帖:
5楼: Originally posted by Probiotics at 2016-12-13 14:28:51
做系统发育树，需要用模式菌株的相应基因序列，用别的菌株是不对的。

序列都是从blast中找的发表过得菌株

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6楼2016-12-13 16:02:23
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可度77

新虫 (小有名气)
求教什么是模式株？

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8楼2016-12-13 16:07:13
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可度77

新虫 (小有名气)
引用回帖:
5楼: Originally posted by Probiotics at 2016-12-13 14:28:51
做系统发育树，需要用模式菌株的相应基因序列，用别的菌株是不对的。

我从百度查了查，说是
亦称模式菌株。在给某细菌定名，分类作记载和发表时，为了使定名准确和作为分类概念的准则，以纯粹活菌（可繁殖）状态所保存的菌种。相当于动植物分类中的模式标本。
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9楼2016-12-13 16:08:17
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可度77

新虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by 边缘未央 at 2016-12-13 14:17:31
可能种间相似程度大 可以多找几个种试试

我说得不准确，应该是红色框里的都是一个种的，都是铜绿假单胞菌。求教！
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10楼2016-12-13 16:10:52
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