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轻轻的来

新虫 (小有名气)

[求助] GROMACS问题求助 已有2人参与

求助大神，本人菜鸟，用GROMACS做bulk体系, nvt结束后跑到了盒子的两边，请高手帮忙看看应该怎么设置能让它们算完了在中间呢

GROMACS问题求助
15.jpg
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1楼 2016-11-07 16:50:35
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hfxywhy

新虫 (初入文坛)
这是因为周期性边界条件，请问楼主解决了吗？
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2楼2017-01-06 08:19:41
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fangsteel

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

体系设置有问题，键长itp文件，原子和键有断裂情况
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gromacs
3楼2017-01-06 11:16:31
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柠檬爱苦茶

新虫 (初入文坛)
trjconv 看这个命令！

发自小木虫Android客户端
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4楼2017-02-25 23:46:49
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18655479372

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

nvt有位置限制的，你有没有先限制一下位置啊
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5楼2017-03-11 09:35:26
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