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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » PCR相关 » 测序序列拼接问题 求助！！
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yaohuaibing

铁杆木虫 (著名写手)

[求助] 测序序列拼接问题 求助！！ 已有4人参与

上下游引物序列都有，用的是ContigExpress.exe软件，请问具体的操作步骤。为什么有的序列对打开是上下游引物序列的正常顺序，有的则是相反的，如果修改，最后要以哪一条链为准，改另一条链的碱基呢？？？求详细说明 谢谢！！！
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每天都在读书和读人。书易懂，人难解。
1楼 2016-05-10 22:16:53
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xp198766

铁杆木虫 (著名写手)

小木虫职业打酱油滴~~！
首先把你的序列去载体，再去低质量部分，得到高质量的序列
再将其中一条反向互补过来
如果overlap短，就取其中一条的一部分，去另一条alignment
如果overlap长，直接align
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8楼2016-05-13 11:27:57
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卡维斯

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
http://wenku.baidu.com/view/a5e2b5bfc77da26925c5b023.html
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2楼2016-05-11 09:35:33
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守望海贝

捐助贵宾 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
序列拼接可以直接用DNAMAN软件拼接，你在论坛里下个软件和说明书就知道了
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3楼2016-05-11 09:47:57
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wangranjun

荣誉版主 (知名作家)

广庭之惘然

优秀版主

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
测序有正向测序和反向测序的分别，以哪一条链为正向对于拼接没有太大的问题。
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他日扬翼九万里，历大千世界，定我红尘心！
4楼2016-05-11 14:49:05
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