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关于qRT-PCR引物的设计
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zfy535251
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关于qRT-PCR引物的设计
已有2人参与
各位师兄师姐,我现在想要设计qRT-PCR引物,说是引物最好要跨两个外显子,那么问题来了,该怎么预测一段序列的外显子及内含子呢?查了一天都没查到合适黄瓜预测的网站,各位有知道的么
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1楼
2016-04-07 16:35:23
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:
Originally posted by
gnot_nail
at 2016-04-09 16:09:02
分别下载基因的cds序列cdna序列…然后在根据cds设计引物,这时会有一个产物大小,然后你在把你的引物在cdna序列里查找 就能知道在cdna里的片段大小,只要cdna里的大小大于在cds里的片段长度,就跨了…一个vector nt ...
cds序列应该就是ncbi里直接查出来的序列吧,cdna序列要在哪里下载呢
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8楼
2016-04-09 18:34:15
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感谢参与,应助指数 +1
softberry上的FGENESH工具可以预测真核生物基因组序列中的外显子、内含子。
http://linux1.softberry.com/berr ... ;amp;subgroup=gfind
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2楼
2016-04-07 18:54:23
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参考基因组选择cucumis melo
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2016-04-07 18:57:14
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3楼
:
Originally posted by
stone2239
at 2016-04-07 18:57:14
参考基因组选择cucumis melo
嗯嗯,谢谢,下课我试一下,不过有人说也可以看ncbi里的CDS信息,这个可以吗
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4楼
2016-04-08 08:13:16
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